RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 NOX5Q96PH1 765 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-204ENST00000587718 SNX12Q9UMY4 172 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-204ENST00000587718 GGPS1O95749 300 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-204ENST00000587718 PSEN2P49810 448 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM206Q9H813 350 aa27.6■■■□□ 2.01
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CAPNS1-204ENST00000587718 SELPP16109 830 aa27.54■■■□□ 2
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