RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587623.1

CTDP1-204, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDP1, Length 435 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-204ENST00000587623 TBX20Q9UMR3 447 aa9.53□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.53□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 COL6A3P12111 3177 aa9.53□□□□□ -0.88
CTDP1-204ENST00000587623 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 MYMKA6NI61 221 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 NRP1O14786 923 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 INPPL1O15357 1258 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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CTDP1-204ENST00000587623 CXCL14O95715 111 aa9.52□□□□□ -0.89
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CTDP1-204ENST00000587623 GRM5P41594 1212 aa9.52□□□□□ -0.89
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CTDP1-204ENST00000587623 ZNF131P52739 623 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 NCKAP1LP55160 1127 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 OSTNP61366 133 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 ASIC1P78348 528 aa9.52□□□□□ -0.89
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CTDP1-204ENST00000587623 ZNF280BQ86YH2 543 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 HVCN1Q96D96 273 aa9.52□□□□□ -0.89
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CTDP1-204ENST00000587623 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.52□□□□□ -0.89
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CTDP1-204ENST00000587623 DNAJB4Q9UDY4 337 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 USP25Q9UHP3 1055 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 KCNH3Q9ULD8 1083 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 PCDHA7Q9UN72 937 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 USP20Q9Y2K6 914 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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CTDP1-204ENST00000587623 FSCN2O14926 492 aa9.5□□□□□ -0.89
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CTDP1-204ENST00000587623 CTSAP10619 480 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 CMA1P23946 247 aa9.5□□□□□ -0.89
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CTDP1-204ENST00000587623 CREMQ03060 361 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 TFF2Q03403 129 aa9.5□□□□□ -0.89
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CTDP1-204ENST00000587623 MCL1Q07820 350 aa9.5□□□□□ -0.89
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CTDP1-204ENST00000587623 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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CTDP1-204ENST00000587623 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 TMEM206Q9H813 350 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 MIOSQ9NXC5 875 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 DPP7Q9UHL4 492 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 CD207Q9UJ71 328 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 ADAM28Q9UKQ2 775 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
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