RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580419.5

SMARCE1-216, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 1,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SMARCE1-216ENST00000580419 NT5DC1Q5TFE4 455 aa15.94■□□□□ 0.14
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SMARCE1-216ENST00000580419 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SMARCE1-216ENST00000580419 ZBTB33Q86T24 672 aa15.94■□□□□ 0.14
SMARCE1-216ENST00000580419 DAW1Q8N136 415 aa15.94■□□□□ 0.14
SMARCE1-216ENST00000580419 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SMARCE1-216ENST00000580419 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SMARCE1-216ENST00000580419 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
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SMARCE1-216ENST00000580419 PRKD2Q9BZL6 878 aa15.94■□□□□ 0.14
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