RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PARP2	Q9UGN5	583 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	NRCAM	Q92823	1304 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MEIS2	O14770	477 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	NCK2	O43639	380 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GNAT1	P11488	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ACPP	P15309	386 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CDC27	P30260	824 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	AVPR2	P30518	371 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PBX3	P40426	434 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TXK	P42681	527 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ANTXR2	P58335	489 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNC3	Q14003	757 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	NEDD9	Q14511	834 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	UBE2S	Q16763	222 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	DUSP6	Q16828	381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	NXPE3	Q969Y0	559 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PLVAP	Q9BX97	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	C12orf49	Q9H741	205 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF19A	Q9NV58	838 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PATJ	Q8NI35	1801 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	CEP250	Q9BV73	2442 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A096LPE4	126 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	HIDE1	A8MVS5	230 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	GNB5	O14775	395 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	FSCN2	O14926	492 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	FGF18	O76093	207 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	ASGR2	P07307	311 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	FGFR1	P11362	822 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	SCG2	P13521	617 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	INSRR	P14616	1297 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	ITGB5	P18084	799 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	RXRA	P19793	462 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	GSTT1	P30711	240 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	DGKG	P49619	791 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	ARL4D	P49703	201 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	DAB2	P98082	770 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	TROAP	Q12815	778 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	PAK2	Q13177	524 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	GRM2	Q14416	872 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-206	ENST00000578093	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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