RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576557.1

ABCC1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 1, human

TSL 4

Gene ABCC1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC1-208	ENST00000576557	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	JAK2	O60674	1132 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	TADA2A	O75478	443 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	SPTBN2	O15020	2390 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	XBP1	P17861	261 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	GLRA2	P23416	452 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	ARL2	P36404	184 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	NTHL1	P78549	312 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	NR5A1	Q13285	461 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	HACE1	Q8IYU2	909 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	NXPE3	Q969Y0	559 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC1-208	ENST00000576557	ANHX	E9PGG2	379 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	LRRN2	O75325	713 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	ZMYND10	O75800	440 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	DGAT1	O75907	488 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	FSHR	P23945	695 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	HTR4	Q13639	388 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	BECN1	Q14457	450 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	FOXQ1	Q9C009	403 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	LYPLA2	O95372	231 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	RARRES1	P49788	294 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	GPC5	P78333	572 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	GRIK3	Q13003	919 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557		A0A1B0GUA9	196 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	POTEM	A6NI47	508 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	PAPLN	O95428	1278 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	SP9	P0CG40	484 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	GLUL	P15104	373 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	KRT2	P35908	639 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	TXK	P42681	527 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	FOSB	P53539	338 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	CREM	Q03060	361 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	CALCRL	Q16602	461 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	FGF14	Q92915	247 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	RMDN1	Q96DB5	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	HINFP	Q9BQA5	517 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCC1-208	ENST00000576557	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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