RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575454.1

SMG6-218, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 652 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-218ENST00000575454 MARCH6O60337 910 aa10.01□□□□□ -0.81
SMG6-218ENST00000575454 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SMG6-218ENST00000575454 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SMG6-218ENST00000575454 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SMG6-218ENST00000575454 EMC2Q15006 297 aa10.01□□□□□ -0.81
SMG6-218ENST00000575454 EPHA7Q15375 998 aa10.01□□□□□ -0.81
SMG6-218ENST00000575454 NTRK3Q16288 839 aa10.01□□□□□ -0.81
SMG6-218ENST00000575454 BMP2KLQ5H9B9 411 aa10.01□□□□□ -0.81
SMG6-218ENST00000575454 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa10.01□□□□□ -0.81
SMG6-218ENST00000575454 KRT25Q7Z3Z0 450 aa10.01□□□□□ -0.81
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SMG6-218ENST00000575454 DEXIO95424 95 aa10□□□□□ -0.81
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SMG6-218ENST00000575454 LXNQ9BS40 222 aa10□□□□□ -0.81
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SMG6-218ENST00000575454 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.99□□□□□ -0.81
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SMG6-218ENST00000575454 PARP2Q9UGN5 583 aa9.99□□□□□ -0.81
SMG6-218ENST00000575454 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SMG6-218ENST00000575454 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.98□□□□□ -0.81
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SMG6-218ENST00000575454 CPA1P15085 419 aa9.98□□□□□ -0.81
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SMG6-218ENST00000575454 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SMG6-218ENST00000575454 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
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SMG6-218ENST00000575454 ST3GAL2Q16842 350 aa9.98□□□□□ -0.81
SMG6-218ENST00000575454 INF2Q27J81 1249 aa9.98□□□□□ -0.81
SMG6-218ENST00000575454 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
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