RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-212ENST00000568900 KAT5Q92993 513 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-212ENST00000568900 FZD8Q9H461 694 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-212ENST00000568900 ACKR2O00590 384 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-212ENST00000568900 B4GALT5O43286 388 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-212ENST00000568900 PHKA2P46019 1235 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-212ENST00000568900 CLDN10P78369 228 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-212ENST00000568900 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-212ENST00000568900 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-212ENST00000568900 VPS36Q86VN1 386 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-212ENST00000568900 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-212ENST00000568900 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-212ENST00000568900 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-212ENST00000568900 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-212ENST00000568900 PTPRJQ12913 1337 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 A0A087WZ62 844 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC172P0C7W6 258 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 TNFSF9P41273 254 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 NT5C1BQ96P26 610 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 FAM189A1O60320 539 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 IQCF3P0C7M6 154 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 ANXA13P27216 316 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 MCL1Q07820 350 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 SETD4Q9NVD3 440 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 NAGPAQ9UK23 515 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 ABLIM1O14639 778 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 MOCS3O95396 460 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 USP8P40818 1118 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 BIRC3Q13489 604 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 ERO1AQ96HE7 468 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 CARD6Q9BX69 1037 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 MYH10P35580 1976 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.21e-12■■■■□ 20.1
SPNS1-212ENST00000568900 ENC1O14682 589 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 OGTO15294 1046 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 F2P00734 622 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 MFAP3P55082 362 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 ZACNQ401N2 412 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 HELQQ8TDG4 1101 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 MAP7D2Q96T17 732 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 CGRRF1Q99675 332 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.22e-6■■□□□ 12.2
SPNS1-212ENST00000568900 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 CENPFP49454 3210 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 PROZP22891 400 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 PSMC4P43686 418 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 POU5F1BQ06416 359 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 KIF22Q14807 665 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 NAB2Q15742 525 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 NLRP7Q8WX94 980 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 TATDN2Q93075 761 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 MNS1Q8NEH6 495 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 KAT2BQ92831 832 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 SCLT1Q96NL6 688 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 TACC1O75410 805 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 IGHA2P01877 340 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 HLA-DRAP01903 254 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 PIK3CAP42336 1068 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 FCGRTP55899 365 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 BEX3Q00994 111 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 TRIM58Q8NG06 486 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-212ENST00000568900 FAM212AQ96EL1 285 aa22.54■■□□□ 1.2
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