RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566915.5

LPCAT2-208, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, human

TSL 1 (best)

Gene LPCAT2, Length 5,285 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPCAT2-208	ENST00000566915	IFNA8	P32881	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	MED21	Q13503	144 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PADI6	Q6TGC4	694 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	COA7	Q96BR5	231 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	MARK3	P27448	753 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	EFNA5	P52803	228 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	INHBE	P58166	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PSMC5	P62195	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	MAP3K10	Q02779	954 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	METTL13	Q8N6R0	699 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	POTEC	B2RU33	542 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	IL10	P22301	178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	HUNK	P57058	714 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CUL3	Q13618	768 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	HIF1A	Q16665	826 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CCNY	Q8ND76	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	BTBD6	Q96KE9	485 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	NFAT5	O94916	1531 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	MAN1A2	O60476	641 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	KRT4	P19013	534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CDC25A	P30304	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SDC4	P31431	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	FOXO4	P98177	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	NOG	Q13253	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	MICALL2	Q8IY33	904 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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