RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22.99■■□□□ 1.27
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SIP14410 1827 aa22.98■■□□□ 1.27
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR44Q5JSH3 913 aa22.98■■□□□ 1.27
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.98■■□□□ 1.27
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP11B1P15538 503 aa22.97■■□□□ 1.27
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CARD9Q9H257 536 aa22.97■■□□□ 1.27
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TAF3Q5VWG9 929 aa22.96■■□□□ 1.27
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.96■■□□□ 1.27
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.96■■□□□ 1.27
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.96■■□□□ 1.27
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VPS18Q9P253 973 aa22.96■■□□□ 1.27
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.95■■□□□ 1.26
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LY6KQ17RY6 165 aa22.94■■□□□ 1.26
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OPTNQ96CV9 577 aa22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.94■■□□□ 1.26
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP1A2P05177 515 aa22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PIK3CAP42336 1068 aa22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CUL1Q13616 776 aa22.94■■□□□ 1.26
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GLG1Q92896 1179 aa22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CGRRF1Q99675 332 aa22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPR20Q99678 358 aa22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADAM21Q9UKJ8 722 aa22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ALG6Q9Y672 507 aa22.94■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SOCS7O14512 581 aa22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EPHX2P34913 555 aa22.93■■□□□ 1.26
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