RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558861.1

LRRC28-209, Transcript of leucine rich repeat containing 28, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC28, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28-209ENST00000558861 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 RASSF10A6NK89 507 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 KATNA1O75449 491 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 TAF5LO75529 589 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 PDE8BO95263 885 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 MMEP08473 750 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 FAHP16930 419 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 SLC5A5Q92911 643 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 VPS33BQ9H267 617 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 TOMM22Q9NS69 142 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 RBPJLQ9UBG7 517 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 MED23Q9ULK4 1368 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 MROH5Q6ZUA9 1318 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 YDJCA8MPS7 323 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 ALG1L2C9J202 215 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 FZD9O00144 591 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 RAB11FIP3O75154 756 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 LRG1P02750 347 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 IL15P40933 162 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 MC3RP41968 323 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 NCKAP1LP55160 1127 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 UBE4AQ14139 1066 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 MLANAQ16655 118 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 TEPPQ6URK8 271 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 FERMT3Q86UX7 667 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 MPHOSPH8Q99549 860 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 ANKRD2Q9GZV1 360 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 SIL1Q9H173 461 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 DCTPP1Q9H773 170 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 ZMAT4Q9H898 229 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 CEP350Q5VT06 3117 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 SCN9AQ15858 1988 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 FOXP2O15409 715 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 PRKD3O94806 890 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 UFL1O94874 794 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 C8BP07358 591 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 THBS2P35442 1172 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 TFCP2Q12800 502 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 MTMR1Q13613 665 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 CR1LQ2VPA4 569 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 BROXQ5VW32 411 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 IQSEC1Q6DN90 963 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 VTA1Q9NP79 307 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 ACSS2Q9NR19 701 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 SPEF2Q9C093 1822 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 ZNF609O15014 1411 aa7.27□□□□□ -1.24
LRRC28-209ENST00000558861 LCHNA4D1U4 455 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 PPIP5K2O43314 1243 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 SURF6O75683 361 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 IGHDP01880 384 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 PDGFRBP09619 1106 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 TMEM253P0C7T8 217 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 SDHAP31040 664 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 CDR1P51861 262 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 TERF2Q15554 542 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 METTL24Q5JXM2 366 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 CD276Q5ZPR3 534 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 SMC5Q8IY18 1101 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 SUPT20HQ8NEM7 779 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 ASB15Q8WXK1 588 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 MTMR8Q96EF0 704 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 SYT3Q9BQG1 590 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 SGPP1Q9BX95 441 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 GPR108Q9NPR9 543 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 RNF181Q9P0P0 153 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 CHD4Q14839 1912 aa7.27□□□□□ -1.25
LRRC28-209ENST00000558861 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms