RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 GHRP10912 638 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 PAK2Q13177 524 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM60Q495X7 471 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 NECAB2Q7Z6G3 386 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC127Q96BQ5 260 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 FAM189A1O60320 539 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 NPTXRO95502 500 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM49P0CI25 452 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM49CP0CI26 452 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 SELPP16109 830 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 PSMD6Q15008 389 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 SEZ6Q53EL9 994 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 TMC6Q7Z403 805 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 SPC24Q8NBT2 197 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 PARD3BQ8TEW8 1205 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 FNBP1Q96RU3 617 aa25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 CLTAP09496 248 aa25.93■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 TLE2Q04725 743 aa25.93■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 LPIN1Q14693 890 aa25.93■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 LRRC8DQ7L1W4 858 aa25.93■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 BRSK2Q8IWQ3 736 aa25.93■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 PPP1R9BQ96SB3 815 aa25.93■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 CHST12Q9NRB3 414 aa25.93■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 A0A1W2PQC6 194 aa25.92■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 PITPNM1O00562 1244 aa25.92■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 TNFSF9P41273 254 aa25.92■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 OSTNP61366 133 aa25.92■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 SURF1Q15526 300 aa25.92■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa25.92■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 ERVK-5Q9HDB9 667 aa25.92■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 PADI3Q9ULW8 664 aa25.92■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.92■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 STAG3L1P0CL83 205 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 DLATP10515 647 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 CD52P31358 61 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 PBX1P40424 430 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 ALPK3Q96L96 1907 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 FMO5P49326 533 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 DLG4P78352 724 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 PTPN21Q16825 1174 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 CEP120Q8N960 986 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 DPF3Q92784 378 aa25.91■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 GRM5P41594 1212 aa25.9■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 CETN1Q12798 172 aa25.9■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 SYCP1Q15431 976 aa25.9■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 TRAF7Q6Q0C0 670 aa25.9■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 FAM212AQ96EL1 285 aa25.9■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 ACAP3Q96P50 834 aa25.9■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 PDE11AQ9HCR9 933 aa25.9■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.9■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 IL18RAPO95256 599 aa25.89■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 GTF2H1P32780 548 aa25.89■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 FAAP100Q0VG06 881 aa25.89■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 HIPK3Q9H422 1215 aa25.89■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.89■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
MEIS3-204ENST00000558555 CITO14578 2027 aa25.89■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 TNNI1P19237 187 aa25.88■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 MYL7Q01449 175 aa25.88■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 C1orf220Q5T0J3 134 aa25.88■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 GBP6Q6ZN66 633 aa25.88■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 CGRRF1Q99675 332 aa25.88■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 CXCL8P10145 99 aa25.88■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 GCLMP48507 274 aa25.88■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 P4HA2O15460 535 aa25.87■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 TPM1P09493 284 aa25.87■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 MXI1P50539 228 aa25.87■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 YARSP54577 528 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 PPP3CAQ08209 521 aa25.87■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 EXOC3L4Q17RC7 722 aa25.87■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 LRRC26Q2I0M4 334 aa25.87■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 UBXN11Q5T124 520 aa25.87■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.87■■□□□ 1.73
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM192Q8IY95 271 aa25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms