RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553944.2

ACTN1-AS1-201, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 484 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 USP20Q9Y2K6 914 aa9.19□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 P4HA2O15460 535 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AFPP02771 609 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CLTAP09496 248 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SELPP16109 830 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FGFR4P22455 802 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GTF2H1P32780 548 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ACOT2P49753 483 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AP3M2P53677 418 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CYP24A1Q07973 514 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PAK2Q13177 524 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PSMD6Q15008 389 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MIIPQ5JXC2 388 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM228AQ86W67 206 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CBWD2Q8IUF1 395 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CD302Q8IX05 232 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC35C1Q96A29 364 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IQCDQ96DY2 449 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PDLIM2Q96JY6 352 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ERGIC2Q96RQ1 377 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FNBP1Q96RU3 617 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PPP1R9BQ96SB3 815 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NUP58Q9BVL2 599 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CDT1Q9H211 546 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 A0A1W2PPC1 479 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PMM2O15305 246 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TEX33O43247 280 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAM189A1O60320 539 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IL18RAPO95256 599 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ADRB2P07550 413 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 STAG3L1P0CL83 205 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SKIP12755 728 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GRM5P41594 1212 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FMO5P49326 533 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 YARSP54577 528 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CLDN10P78369 228 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TLE2Q04725 743 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 VSTM4Q8IW00 320 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BRSK2Q8IWQ3 736 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 THNSL1Q8IYQ7 743 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HACE1Q8IYU2 909 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ACAP3Q96P50 834 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TSPAN18Q96SJ8 248 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FTHL17Q9BXU8 183 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PADI3Q9ULW8 664 aa9.17□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NPTXRO95502 500 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TPM1P09493 284 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GHRP10912 638 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TNNI1P19237 187 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CD52P31358 61 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PBX1P40424 430 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RAB27AP51159 221 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FAAP100Q0VG06 881 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRIM14Q14142 442 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LPIN1Q14693 890 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRIM60Q495X7 471 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KRT39Q6A163 491 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GBP6Q6ZN66 633 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 WDR49Q8IV35 697 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 APBB2Q92870 758 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CCDC127Q96BQ5 260 aa9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HIPK3Q9H422 1215 aa9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms