RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DPH6Q7L8W6 267 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 GDAP1Q8TB36 358 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SCFD2Q8WU76 684 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RUBCNQ92622 972 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CDKL2Q92772 493 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ACCSQ96QU6 501 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 LCMT1Q9UIC8 334 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 LZTS1Q9Y250 596 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DAB1O75553 588 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PRKACAP17612 351 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TNNI1P19237 187 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SGO2Q562F6 1265 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ANO5Q75V66 913 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TMX3Q96JJ7 454 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RMDN3Q96TC7 470 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 TBK1Q9UHD2 729 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB5O15062 677 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ASAP2O43150 1006 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PRKACBP22694 351 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 LIFRP42702 1097 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PPATQ06203 517 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF174Q15697 407 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PI16Q6UXB8 463 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 HORMAD1Q86X24 394 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MKS1Q9NXB0 559 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 STK17AQ9UEE5 414 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 EFCAB14O75071 495 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 GCNT3O95395 438 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 GJB1P08034 283 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CENPAP49450 140 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PASD1Q8IV76 773 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DACT1Q9NYF0 836 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 NCDNQ9UBB6 729 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 GGA2Q9UJY4 613 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 GMEB2Q9UKD1 530 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 BCL9O00512 1426 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf81A6NN90 581 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SFI1A8K8P3 1242 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ORC4O43929 436 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 IL32P24001 234 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 AFMP43652 599 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC3Q13217 504 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SBK1Q52WX2 424 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 NEDD1Q8NHV4 660 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CEP170P1Q96L14 293 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FAM20AQ96MK3 541 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 BRD9Q9H8M2 597 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GVL5 298 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 K7ENM7 598 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 MATN2O00339 956 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 ANGPT2O15123 496 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 IDH3BO43837 385 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 AP1B1Q10567 949 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 PDIA5Q14554 519 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 FAM83BQ5T0W9 1011 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL29Q96CT2 875 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 NRBF2Q96F24 287 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CDCA5Q96FF9 252 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-210ENST00000551525 CNPY3Q9BT09 278 aa6.67□□□□□ -1.34
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