RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 CDC42EP1Q00587 391 aa10.68□□□□□ -0.7
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CS-217ENST00000550044 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
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CS-217ENST00000550044 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-217ENST00000550044 TCP11Q8WWU5 503 aa10.68□□□□□ -0.7
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CS-217ENST00000550044 GAS2O43903 313 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
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CS-217ENST00000550044 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-217ENST00000550044 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-217ENST00000550044 CYP11B2P19099 503 aa10.66□□□□□ -0.7
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CS-217ENST00000550044 FAM102BQ5T8I3 360 aa10.66□□□□□ -0.7
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CS-217ENST00000550044 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-217ENST00000550044 TLE6Q9H808 572 aa10.66□□□□□ -0.7
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CS-217ENST00000550044 TPRP12270 2363 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
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CS-217ENST00000550044 FRYLO94915 3013 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-217ENST00000550044 C9IYK1 514 aa10.65□□□□□ -0.7
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CS-217ENST00000550044 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
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CS-217ENST00000550044 SARSP49591 514 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
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CS-217ENST00000550044 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CS-217ENST00000550044 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
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CS-217ENST00000550044 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
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CS-217ENST00000550044 DGKIO75912 1065 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 BRD1O95696 1058 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 F13A1P00488 732 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 STAG3L1P0CL83 205 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 LONP1P36776 959 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 PHKA2P46019 1235 aa10.64□□□□□ -0.71
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