RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 PTPRN2Q92932 1015 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 NYXQ9GZU5 481 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 CTNNA3Q9UI47 895 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 WNK3Q9BYP7 1800 aa6.34□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PLD2O14939 933 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PFKFB2O60825 505 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 IDH1O75874 414 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CLSTN1O94985 981 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CTDNEP1O95476 244 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GYG1P46976 350 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 EVCP57679 992 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GABREP78334 506 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 STK3Q13188 491 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 KCNAB2Q13303 367 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ALX1Q15699 326 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CR1LQ2VPA4 569 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 STYK1Q6J9G0 422 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 Q8N1Y9 231 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GPT2Q8TD30 523 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GTF3C6Q969F1 213 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.33□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ZNF213O14771 459 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PRKAB2O43741 272 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 JAK2O60674 1132 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MSCO60682 206 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GYS1P13807 737 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 RFC4P35249 363 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GYS2P54840 703 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ANTXR2P58335 489 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 HAND2P61296 217 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ADAM9Q13443 819 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 TESK1Q15569 626 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CEP68Q76N32 757 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CHST3Q7LGC8 479 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 FEZ1Q99689 392 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ARMT1Q9H993 441 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GPR27Q9NS67 375 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 X6R8D5 127 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 COL4A1P02462 1669 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 LRP5O75197 1615 aa6.32□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PRC1O43663 620 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MYO1BO43795 1136 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 B4GALT3O60512 393 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 KLRK1P26718 216 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 BCL6P41182 706 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MAP3K12Q12852 859 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MROH9Q5TGP6 573 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 BORAQ6PGQ7 559 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.31□□□□□ -1.4
TRDN-205ENST00000546248 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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