RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 PTPRHQ9HD43 1115 aa26.56■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 SLC38A7Q9NVC3 462 aa26.56■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 FAM13BQ9NYF5 915 aa26.56■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 PROZP22891 400 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 KCNQ1P51787 676 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 CREMQ03060 361 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 EEF1DP3Q658K8 133 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 IQUBQ8NA54 791 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 HVCN1Q96D96 273 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 UROC1Q96N76 676 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 MAGEF1Q9HAY2 307 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 KLK14Q9P0G3 267 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 DPP7Q9UHL4 492 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 CD207Q9UJ71 328 aa26.55■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 C2orf71A6NGG8 1288 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 TTLL13PA6NNM8 815 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 SOD2P04179 222 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 URODP06132 367 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 ME1P48163 572 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 LIG4P49917 911 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 USP49Q70CQ1 688 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 GSTCDQ8NEC7 633 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 CDT1Q9H211 546 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 TNMDQ9H2S6 317 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 PRKAG3Q9UGI9 489 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 GDAQ9Y2T3 454 aa26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 GRXCR2A6NFK2 248 aa26.53■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 COASYQ13057 564 aa26.53■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 ALCAMQ13740 583 aa26.53■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 TAS1R3Q7RTX0 852 aa26.53■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 DDX12PQ92771 950 aa26.53■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 TSPAN18Q96SJ8 248 aa26.53■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa26.53■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 MIOSQ9NXC5 875 aa26.53■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 TBX20Q9UMR3 447 aa26.53■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 H3BQ06 376 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 TADA2AO75478 443 aa26.52■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 KRT85P78386 507 aa26.52■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 GTF2BQ00403 316 aa26.52■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 MCL1Q07820 350 aa26.52■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 KIAA1841Q6NSI8 718 aa26.52■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa26.52■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa26.52■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 ADAM28Q9UKQ2 775 aa26.52■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 EXOC7Q9UPT5 735 aa26.52■■□□□ 1.84
PITX3-202ENST00000539804 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 TNFRSF10AO00220 468 aa26.51■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 C1RP00736 705 aa26.51■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 PIGRP01833 764 aa26.51■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 EDN1P05305 212 aa26.51■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 LTBRP36941 435 aa26.51■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.51■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 SLFN12LQ6IEE8 588 aa26.51■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 PDXDC1Q6P996 788 aa26.51■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa26.51■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 DZANK1Q9NVP4 752 aa26.51■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa26.51■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 HIDE1A8MVS5 230 aa26.5■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 PER2O15055 1255 aa26.5■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 USP41Q3LFD5 358 aa26.5■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 DYMQ7RTS9 669 aa26.5■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 ZBTB33Q86T24 672 aa26.5■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 CCDC65Q8IXS2 484 aa26.5■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.5■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 USP20Q9Y2K6 914 aa26.5■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa26.5■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 A0A0C4DFX4 3053 aa26.49■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 TRAPPC3O43617 180 aa26.49■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 TBX10O75333 385 aa26.49■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 GLUD2P49448 558 aa26.49■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 XKR4Q5GH76 650 aa26.49■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 MAP4K3Q8IVH8 894 aa26.49■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 LRRC15Q8TF66 581 aa26.49■■□□□ 1.83
PITX3-202ENST00000539804 MSLNLQ96KJ4 702 aa26.49■■□□□ 1.83
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