RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM9Q9C026 710 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 OLFML3Q9NRN5 406 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 COL6A3P12111 3177 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1B0GVL5 298 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 PIGRP01833 764 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 PFKFB1P16118 471 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 ASIC1P78348 528 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 TCEAL5Q5H9L2 206 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 COLGALT2Q8IYK4 626 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 GSTCDQ8NEC7 633 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 IGSF21Q96ID5 467 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 USP25Q9UHP3 1055 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PQ27 194 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PQ64 194 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PQD8 194 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 ABLIM1O14639 778 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 THP07101 528 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 OR1G1P47890 313 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 OSTNP61366 133 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 MCL1Q07820 350 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 DSC1Q08554 894 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 ALCAMQ13740 583 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 CEP120Q8N960 986 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 ACAP3Q96P50 834 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D7Q9P0N9 293 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 THEGQ9P2T0 379 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 STK39Q9UEW8 545 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 COG5Q9UP83 839 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRK-222ENST00000532751 NRP1O14786 923 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 B4GALT3O60512 393 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 GCNT3O95395 438 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 SLFN14P0C7P3 912 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 IRS1P35568 1242 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 COASYQ13057 564 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 CNNM4Q6P4Q7 775 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 TMC7Q7Z402 723 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 EXOC7Q9UPT5 735 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 NCK2O43639 380 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 SYKP43405 635 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 AFMP43652 599 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 ERVFC1P60507 584 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 TUSC3Q13454 348 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 KYAT1Q16773 422 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 TPRNQ4KMQ1 711 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 HLA-CQ95604 372 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 ACCSQ96QU6 501 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 TCF25Q9BQ70 676 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 COLEC11Q9BWP8 271 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 PRDM6Q9NQX0 595 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 HPSEQ9Y251 543 aa24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 PTGESO14684 152 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 FSCN2O14926 492 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R37O75864 691 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 PLPP4Q5VZY2 271 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 FSIP1Q8NA03 581 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 SLFN12LQ6IEE8 588 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 UNC13DQ70J99 1090 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 VPS52Q8N1B4 723 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 MSTO1Q9BUK6 570 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 STRA6Q9BX79 667 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 CA8P35219 290 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 SNX27Q96L92 541 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 IGFLR1Q9H665 355 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 FSD2A1L4K1 749 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 OGTO15294 1046 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 CLTAP09496 248 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 MYBP10242 640 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 NDUFA8P51970 172 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 HYAL1Q12794 435 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 POSTNQ15063 836 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 AAK1Q2M2I8 961 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 SEZ6Q53EL9 994 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRK-222ENST00000532751 XKR4Q5GH76 650 aa23.96■■□□□ 1.43
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