RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531184.5

GSDMD-211, Transcript of gasdermin D, humanhuman

TSL 2

Gene GSDMD, Length 2,213 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMD-211ENST00000531184 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.14■■□□□ 1.14
GSDMD-211ENST00000531184 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
GSDMD-211ENST00000531184 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.14■■□□□ 1.14
GSDMD-211ENST00000531184 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 PDE4DQ08499 809 aa22.14■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.14■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 RFWD3Q6PCD5 774 aa22.14■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 PEX26Q7Z412 305 aa22.14■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.14■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.14■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 SERPINB12Q96P63 405 aa22.14■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 PARP2Q9UGN5 583 aa22.14■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.14■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 TMED5Q9Y3A6 229 aa22.14■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 A6NJR5 290 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 TAC1P20366 129 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ADD2P35612 726 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ZAP70P43403 619 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 STK4Q13043 487 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 NPY5RQ15761 445 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ACSBG2Q5FVE4 666 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 CENPPQ6IPU0 288 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 CCDC174Q6PII3 467 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 SCUBE1Q8IWY4 988 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 CERS5Q8N5B7 392 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 SPATA5Q8NB90 893 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.13■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.136e-8■■■□□ 19
GSDMD-211ENST00000531184 ASMTLO95671 621 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 RARGP13631 454 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 FUT4P22083 530 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 CDR2Q01850 454 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 GSTM4Q03013 218 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 STRN3Q13033 797 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 TNIP1Q15025 636 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 CFAP157Q5JU67 520 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ZNF449Q6P9G9 518 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 SMARCA1P28370 1054 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 MCM7P33993 719 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 SAR1AQ9NR31 198 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ATP8B3O60423 1300 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.12■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 GLTPD2A6NH11 291 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 GRIK5Q16478 980 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 GPC2Q8N158 579 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 INIPQ9NRY2 104 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 GH1P01241 217 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 CREB1P16220 341 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 HOXD12P35452 270 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 MOGSQ13724 837 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 FAM47EQ6ZV65 393 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 JAMLQ86YT9 394 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 STMN2Q93045 179 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 HES6Q96HZ4 224 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 SNX24Q9Y343 169 aa22.11■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 NOL4O94818 638 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 CBX6O95503 412 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 FGGP02679 453 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 NEK3P51956 506 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.1■■□□□ 1.13
GSDMD-211ENST00000531184 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms