RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PSMD6	Q15008	389 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPA17	Q15506	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KRT39	Q6A163	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	USP37	Q86T82	979 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC35F6	Q8N357	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	BICD1	Q96G01	975 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GPR88	Q9GZN0	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	COL1A2	P08123	1366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854		A0A087X0T9	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854		F8VZ95	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854		H3BRB1	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ACKR2	O00590	384 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ABLIM1	O14639	778 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAGEB2	O15479	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GFPT2	O94808	682 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MMP3	P08254	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM228B	P0C875	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	INSRR	P14616	1297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KLRC1	P26715	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SOX5	P35711	763 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MXI1	P50539	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GPC3	P51654	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PTEN	P60484	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PTK2	Q05397	1052 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SREBF2	Q12772	1141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GRM1	Q13255	1194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TFDP1	Q14186	410 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KIF22	Q14807	665 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms