RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 POGKQ9P215 609 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 A0A087X1B8 175 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 GAGE12BA1L429 117 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 LAG3P18627 525 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 ECHS1P30084 290 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 MTNR1BP49286 362 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 NHLH2Q02577 135 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 MALLQ13021 153 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 SYT12Q8IV01 421 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 MYEOVQ96EZ4 313 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 MENTQ9BUN1 341 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 MCM8Q9UJA3 840 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 WASHC2AQ641Q2 1341 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 FOXN1O15353 648 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 ADCY6O43306 1168 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 KRT4P19013 534 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 MCAMP43121 646 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 CLRN1P58418 232 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 PPP3CAQ08209 521 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 SP140Q13342 867 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 PTPAQ15257 358 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 REPS2Q8NFH8 660 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 COG1Q8WTW3 980 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 IGSF3O75054 1194 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 ABHD16AO95870 558 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 IL2RBP14784 551 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 SREBF1P36956 1147 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 PER3P56645 1201 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 FAM189BP81408 668 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 LAIR1Q6GTX8 287 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 ADI1Q9BV57 179 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 SLC5A4Q9NY91 659 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 DRGXA6NNA5 263 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 RAMP2O60895 175 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 METRNLQ641Q3 311 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 PLXDC1Q8IUK5 500 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 MLST8Q9BVC4 326 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 DKK2Q9UBU2 259 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 TRIM75PA6NK02 468 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 ENDOD1O94919 500 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 BMPR1AP36894 532 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 NOMO1Q15155 1222 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 KCNV1Q6PIU1 500 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 PCSK4Q6UW60 755 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 RNF169Q8NCN4 708 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 TTPALQ9BTX7 342 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 DMRT3Q9NQL9 472 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-221ENST00000514231 COL4A3Q01955 1670 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms