RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506928.5

POLK-208, Transcript of DNA polymerase kappa, human

TSL 5

Gene POLK, Length 3,820 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLK-208	ENST00000506928	ZBTB16	Q05516	673 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	TLR1	Q15399	786 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	CCDC138	Q96M89	665 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	FAM20A	Q96MK3	541 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	LTN1	O94822	1766 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	CACNA1S	Q13698	1873 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	CCDC151	A5D8V7	595 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928		C9IYK1	514 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	TPP1	O14773	563 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	PROM1	O43490	865 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	PAPLN	O95428	1278 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	POTEJ	P0CG39	1038 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	PLCG2	P16885	1265 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	HNMT	P50135	292 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	CDK17	Q00537	523 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	GEN1	Q17RS7	908 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	CCDC38	Q502W7	563 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	RUFY3	Q7L099	469 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	EFHB	Q8N7U6	833 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	NT5C1B	Q96P26	610 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	MYD88	Q99836	296 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	EDEM2	Q9BV94	578 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	EHD1	Q9H4M9	534 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	THAP9	Q9H5L6	903 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	DNM3	Q9UQ16	869 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	POLH	Q9Y253	713 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		5.06	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	ZFHX3	Q15911	3703 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	PDLIM1	O00151	329 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	EXTL3	O43909	919 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	SRGAP2	O75044	1071 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	MCM3	P25205	808 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	KRT9	P35527	623 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	CETN2	P41208	172 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	AK2	P54819	239 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	SLC26A5	P58743	744 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	GPR85	P60893	370 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	COASY	Q13057	564 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	SCARB2	Q14108	478 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	DPYS	Q14117	519 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	FAM26D	Q5JW98	314 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	TPGS2	Q68CL5	300 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	NLRP8	Q86W28	1048 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	PALB2	Q86YC2	1186 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	URGCP	Q8TCY9	931 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	NINJ1	Q92982	152 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	VPS39	Q96JC1	886 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	TBATA	Q96M53	351 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	HINFP	Q9BQA5	517 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	DKK3	Q9UBP4	350 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	MYH3	P11055	1940 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	MAPK13	O15264	365 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	GREM1	O60565	184 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	TSC22D2	O75157	780 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	PRDM1	O75626	825 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	S100A6	P06703	90 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	SDS	P20132	328 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	KEL	P23276	732 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	IFNAR2	P48551	515 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	B2M	P61769	119 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	STK38	Q15208	465 aa		5.05	□□□□□ -1.6
POLK-208	ENST00000506928	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6	1e-6	■■■■■ 27.4

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms