RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504927.5

DDR1-255, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene DDR1, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-255ENST00000504927 MCL1Q07820 350 aa22.63■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 GRIK3Q13003 919 aa22.63■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 KYAT1Q16773 422 aa22.63■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 ZBTB33Q86T24 672 aa22.63■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.63■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 TMEM169Q96HH4 297 aa22.63■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 ACAP3Q96P50 834 aa22.63■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.63■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 GDAQ9Y2T3 454 aa22.63■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 MYH11P35749 1972 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 NCK2O43639 380 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 THP07101 528 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 DNAJB1P25685 340 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 PBX3P40426 434 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 SYKP43405 635 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 DSC1Q08554 894 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 CAMK1Q14012 370 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 IGSF21Q96ID5 467 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 STRA6Q9BX79 667 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 TLR9Q9NR96 1032 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.62■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.61■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 PPP1R37O75864 691 aa22.61■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 SLC11A1P49279 550 aa22.61■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 ASIC1P78348 528 aa22.61■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.61■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.61■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.61■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.61■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.6■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.6■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 NRP1O14786 923 aa22.6■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 MYL1P05976 194 aa22.6■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 COASYQ13057 564 aa22.6■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.6■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 ACCSQ96QU6 501 aa22.6■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.6■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.6■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.6■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.6■■□□□ 1.21
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DDR1-255ENST00000504927 GCNT3O95395 438 aa22.59■■□□□ 1.21
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DDR1-255ENST00000504927 OSTNP61366 133 aa22.59■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 TUSC3Q13454 348 aa22.59■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 POSTNQ15063 836 aa22.59■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 XKR4Q5GH76 650 aa22.59■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 UNC13DQ70J99 1090 aa22.59■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 FSIP1Q8NA03 581 aa22.59■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 PAGE5Q96GU1 130 aa22.59■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 COG5Q9UP83 839 aa22.59■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.59■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 A0A0B4J269 797 aa22.58■■□□□ 1.21
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DDR1-255ENST00000504927 OR1G1P47890 313 aa22.58■■□□□ 1.21
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DDR1-255ENST00000504927 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.58■■□□□ 1.21
DDR1-255ENST00000504927 TMEM206Q9H813 350 aa22.58■■□□□ 1.21
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DDR1-255ENST00000504927 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.57■■□□□ 1.2
DDR1-255ENST00000504927 OGTO15294 1046 aa22.57■■□□□ 1.2
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DDR1-255ENST00000504927 TMC7Q7Z402 723 aa22.57■■□□□ 1.2
DDR1-255ENST00000504927 HLA-CQ95604 372 aa22.57■■□□□ 1.2
DDR1-255ENST00000504927 TCF25Q9BQ70 676 aa22.57■■□□□ 1.2
DDR1-255ENST00000504927 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.57■■□□□ 1.2
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DDR1-255ENST00000504927 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.57■■□□□ 1.2
DDR1-255ENST00000504927 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.56■■□□□ 1.2
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DDR1-255ENST00000504927 ZNF202O95125 648 aa22.56■■□□□ 1.2
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DDR1-255ENST00000504927 KCNE1P15382 129 aa22.56■■□□□ 1.2
DDR1-255ENST00000504927 IRS1P35568 1242 aa22.56■■□□□ 1.2
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