RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504849.5

RFC1-208, Transcript of replication factor C subunit 1, human

TSL 3

Gene RFC1, Length 873 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFC1-208	ENST00000504849	ECI1	P42126	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	NUCB2	P80303	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	RHD	Q02161	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	STK3	Q13188	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	DDB1	Q16531	1140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	EDA	Q92838	391 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	BRF1	Q92994	677 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	MYD88	Q99836	296 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	IL16	Q14005	1332 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PLCH2	O75038	1416 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	USP32	Q8NFA0	1604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CEP152	O94986	1710 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	TET3	O43151	1660 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ABCC1	P33527	1531 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	WNT9A	O14904	365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	GSTA4	O15217	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	OFD1	O75665	1012 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ZBED1	O96006	694 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CKM	P06732	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	KRT4	P19013	534 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	MCM5	P33992	734 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	IL13	P35225	146 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CCT5	P48643	541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PAK1	Q13153	545 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849		Q6ZPA2	131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SRL	Q86TD4	932 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFC1-208	ENST00000504849	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFC1-208	ENST00000504849	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFC1-208	ENST00000504849	DDIT3	P35638	169 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFC1-208	ENST00000504849	TM4SF4	P48230	202 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFC1-208	ENST00000504849	USP14	P54578	494 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFC1-208	ENST00000504849	PHC1	P78364	1004 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFC1-208	ENST00000504849	NUCB1	Q02818	461 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFC1-208	ENST00000504849	LRRC32	Q14392	662 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFC1-208	ENST00000504849	ODF1	Q14990	250 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFC1-208	ENST00000504849	RABEP1	Q15276	862 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFC1-208	ENST00000504849	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFC1-208	ENST00000504849	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFC1-208	ENST00000504849	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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