RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 CCNA1P78396 465 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 PSMD6Q15008 389 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 IER5Q5VY09 327 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 SLFN11Q7Z7L1 901 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 HELQQ8TDG4 1101 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ATP8B4Q8TF62 1192 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 GLG1Q92896 1179 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 KAT5Q92993 513 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 NT5C1BQ96P26 610 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 PSMB7Q99436 277 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CES2O00748 559 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 PAFAH1B1P43034 410 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 SLC26A2P50443 739 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 C2orf54Q08AI8 447 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 TTLL4Q14679 1199 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC181Q5TID7 509 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 PALB2Q86YC2 1186 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 DOCK3Q8IZD9 2030 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 TCP11Q8WWU5 503 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 RFFLQ8WZ73 363 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 KAT6AQ92794 2004 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA33Q96N06 139 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CPA4Q9UI42 421 aa8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0B4J269 797 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD62A6NC57 917 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 EDN1P05305 212 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 MCM3P25205 808 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 EFNA5P52803 228 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CBX1P83916 185 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 GCNT1Q02742 428 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 DRP2Q13474 957 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 PLCB4Q15147 1175 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ARMCX2Q7L311 632 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM50Q86XT4 487 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 KRT222Q8N1A0 295 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 SCFD2Q8WU76 684 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 SLC20A1Q8WUM9 679 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF516Q92618 1163 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 COPS5Q92905 334 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 FAM81BQ96LP2 452 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 FUT8Q9BYC5 575 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ISCUQ9H1K1 167 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 KIF4AO95239 1232 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 KCNA4P22459 653 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MARK3P27448 753 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 RPS6KA1Q15418 735 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ZACNQ401N2 412 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ZPBP2Q6X784 338 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 FNBP1Q96RU3 617 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC113Q9H0I3 377 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ABCB6Q9NP58 842 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.83□□□□□ -1
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