RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 GANQ9H2C0 597 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 FBXL5Q9UKA1 691 aa11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CDH23Q9H251 3354 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A087WZ62 844 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TOM1L1O75674 476 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 VTNP04004 478 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 GTF2H1P32780 548 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 GPC3P51654 580 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 DLG4P78352 724 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ADAM17P78536 824 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PPP3CAQ08209 521 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CETN1Q12798 172 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CBWD6Q4V339 395 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CBWD3Q5JTY5 395 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 GNASQ5JWF2 1037 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 CBWD5Q5RIA9 395 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 C9orf50Q5SZB4 431 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 WDR59Q6PJI9 974 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ARRDC4Q8NCT1 418 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PARD3BQ8TEW8 1205 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM213AQ9BRX8 229 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MSTO1Q9BUK6 570 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 HAPLN2Q9GZV7 340 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 IFT122Q9HBG6 1241 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 SIX2Q9NPC8 291 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 GCNT4Q9P109 453 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 MYO6Q9UM54 1294 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 USP20Q9Y2K6 914 aa11.65□□□□□ -0.54
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM265A0A087WTH1 108 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 C17orf102A2RUQ5 167 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 MYADML2A6NDP7 307 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 LRRC53A6NM62 1247 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 ABLIM1O14639 778 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 CLDN3O15551 220 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 ZSCAN12O43309 604 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 GNAT1P11488 350 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 CYP2C9P11712 490 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 ACTN1P12814 892 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 PROZP22891 400 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 HOXC8P31273 242 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 CHMP4BP1P59074 171 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 MCL1Q07820 350 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 PSMD6Q15008 389 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 EPC2Q52LR7 807 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 MPZL3Q6UWV2 235 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 RAD9BQ6WBX8 426 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 RRAGAQ7L523 313 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM117Q9H0C3 514 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM8AQ9HCN3 771 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 PTPRHQ9HD43 1115 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.64□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 KBTBD13C9JR72 458 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 OGTO15294 1046 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 ADAMTS4O75173 837 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 PGK1P00558 417 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 UCHL3P15374 230 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 CST5P28325 142 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 GCLMP48507 274 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 MXI1P50539 228 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 CLDN10P78369 228 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 SNX17Q15036 470 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 AMHR2Q16671 573 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 SFMBT2Q5VUG0 894 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 KRT39Q6A163 491 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 C7orf31Q8N865 590 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 KLHDC9Q8NEP7 349 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 LMO3Q8TAP4 145 aa11.63□□□□□ -0.55
ECHDC3-204ENST00000495787 NLRP7Q8WX94 980 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms