RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 COL4A3Q01955 1670 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 IGF2RP11717 2491 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ESYT2A0FGR8 921 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SOBPA7XYQ1 873 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 MSH4O15457 936 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SGSM2O43147 1006 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 EFEMP2O95967 443 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 POU2F2P09086 479 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CHMLP26374 656 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 FNTBP49356 437 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PSMC5P62195 406 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SATB1Q01826 763 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 LRRC32Q14392 662 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 GRM2Q14416 872 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 UVSSAQ2YD98 709 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 RTP2Q5QGT7 225 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 UBXN11Q5T124 520 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 TTC22Q5TAA0 569 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 RTL10Q7L3V2 364 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 LONP2Q86WA8 852 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CCDC148Q8NFR7 591 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 HASPINQ8TF76 798 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 TCP11Q8WWU5 503 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 MAP4K1Q92918 833 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CSRNP2Q9H175 543 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PARP2Q9UGN5 583 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 HES2Q9Y543 173 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PPME1Q9Y570 386 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ZNF197O14709 1029 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 AXIN1O15169 862 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ASAP2O43150 1006 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 HRO43593 1189 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 LRG1P02750 347 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 RHOP08100 348 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 C1QTNF9P0C862 333 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 GDI1P31150 447 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ELF1P32519 619 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 RFC5P40937 340 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 FGD1P98174 961 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 FZD5Q13467 585 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 TFDP1Q14186 410 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 STPG1Q5TH74 334 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PLA2G4FQ68DD2 849 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 RABGGTAQ92696 567 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SLC5A5Q92911 643 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 COL26A1Q96A83 441 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 TMEM143Q96AN5 459 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 LENG9Q96B70 501 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 MSANTD3Q96H12 275 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CEP170P1Q96L14 293 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CEP89Q96ST8 783 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 RNF39Q9H2S5 420 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 ZZEF1O43149 2961 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms