RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489053.1

HDAC6-232, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 539 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-232ENST00000489053 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa10.01□□□□□ -0.81
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HDAC6-232ENST00000489053 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa10.01□□□□□ -0.81
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HDAC6-232ENST00000489053 SLC38A7Q9NVC3 462 aa10.01□□□□□ -0.81
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HDAC6-232ENST00000489053 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HDAC6-232ENST00000489053 LIN9Q5TKA1 542 aa9.98□□□□□ -0.81
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HDAC6-232ENST00000489053 TMC5Q6UXY8 1006 aa9.98□□□□□ -0.81
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