RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 FAM71AQ8IYT1 594 aa23.51■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 TATDN2Q93075 761 aa23.51■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 NT5C1BQ96P26 610 aa23.51■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.51■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.51■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 SNX12Q9UMY4 172 aa23.51■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 ATP8B3O60423 1300 aa23.5■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.5■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 ABLIM1O14639 778 aa23.5■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 TOM1L1O75674 476 aa23.5■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 TNNI1P19237 187 aa23.5■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 MFAP3P55082 362 aa23.5■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 ZACNQ401N2 412 aa23.5■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 RGMBQ6NW40 437 aa23.5■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23.5■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 ZBTB33Q86T24 672 aa23.5■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 PALB2Q86YC2 1186 aa23.5■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 SHC3Q92529 594 aa23.5■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa23.5■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 ZNF185O15231 689 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 NCK2O43639 380 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 PALMO75781 387 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 H2AFZP0C0S5 128 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 USP8P40818 1118 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 TFDP1Q14186 410 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 IQSEC1Q6DN90 963 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 H2AFVQ71UI9 128 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 AGPAT1Q99943 283 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 MMP3P08254 477 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 TNFAIP3P21580 790 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 TNFSF9P41273 254 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 PTENP60484 403 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 MAP2K5Q13163 448 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 RABGGTAQ92696 567 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 CAPZA3Q96KX2 299 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 TCHPQ9BT92 498 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 TLR10Q9BXR5 811 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 FZD8Q9H461 694 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.49■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.48■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 H3BRB1 525 aa23.48■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 SGPL1O95470 568 aa23.48■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 CTAGE8P0CG41 777 aa23.48■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 GALCP54803 685 aa23.48■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 CTAGE6Q86UF2 777 aa23.48■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 CTAGE4Q8IX94 777 aa23.48■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 MMS19Q96T76 1030 aa23.48■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.48■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 TAS2R14Q9NYV8 317 aa23.48■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 INTUQ9ULD6 942 aa23.48■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 ACKR2O00590 384 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 ASAP2O43150 1006 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 CYP26A1O43174 497 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 B4GALT5O43286 388 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 VNN1O95497 513 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 HLA-DRAP01903 254 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 C17orf99Q6UX52 265 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 IFNL1Q8IU54 200 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 CGRRF1Q99675 332 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 ACP6Q9NPH0 428 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 SLC10A3P09131 477 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 IQCF3P0C7M6 154 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 PROZP22891 400 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 MCL1Q07820 350 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 BRSK2Q8IWQ3 736 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 OR5B17Q8NGF7 314 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 EPS8L1Q8TE68 723 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 PTPRHQ9HD43 1115 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 COL1A2P08123 1366 aa23.47■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.46■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 MAGEB2O15479 319 aa23.46■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 PRLRP16471 622 aa23.46■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 TNFAIP2Q03169 654 aa23.46■■□□□ 1.35
USP13-202ENST00000482333 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms