RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482085.1

ACTA2-205, Transcript of actin, alpha 2, smooth muscle, aorta, human

TSL 2

Gene ACTA2, Length 755 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACTA2-205	ENST00000482085	ZNF131	P52739	623 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	TUSC3	Q13454	348 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	CLUL1	Q15846	466 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	KCNN1	Q92952	543 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	IRAK3	Q9Y616	596 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	PTGES	O14684	152 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	TOM1L1	O75674	476 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	UROD	P06132	367 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	MCF2	P10911	925 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	PROZ	P22891	400 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	ABCD1	P33897	745 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	GRM5	P41594	1212 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	STAT6	P42226	847 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	COASY	Q13057	564 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	PKP1	Q13835	747 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	MYCT1	Q8N699	235 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	CLEC1B	Q9P126	229 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	VWA8	A3KMH1	1905 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	MUC3A	Q02505	3323 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	ABLIM1	O14639	778 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	MBTPS2	O43462	519 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	TRAK2	O60296	914 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	BRD1	O95696	1058 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	SOD2	P04179	222 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	TH	P07101	528 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	ANK1	P16157	1881 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	DDIT3	P35638	169 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	KCNC3	Q14003	757 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	CEP120	Q8N960	986 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	CASP10	Q92851	521 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	BICD1	Q96G01	975 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	CUTA	O60888	179 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	CXCL14	O95715	111 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	GLUD2	P49448	558 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	LIG4	P49917	911 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	SV2B	Q7L1I2	683 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	ZBTB33	Q86T24	672 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	SNX27	Q96L92	541 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	TCHH	Q07283	1943 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085		A0A087X0B3	334 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085		F8W810	466 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	CLDN3	O15551	220 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	KIF4A	O95239	1232 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ACTA2-205	ENST00000482085	EFEMP2	O95967	443 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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