RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 MCM7P33993 719 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 IRS1P35568 1242 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 PBX3P40426 434 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 GPC3P51654 580 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 CCZ1BP86790 482 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 HYAL1Q12794 435 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 LRMPQ12912 555 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 DSC3Q14574 896 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 SYCP1Q15431 976 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 PTPN14Q15678 1187 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 ANO5Q75V66 913 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 NEK8Q86SG6 692 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 PDILTQ8N807 584 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 HAS1Q92839 578 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 DYDC2Q96IM9 177 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 EPSTI1Q96J88 318 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 CD320Q9NPF0 282 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 RGS18Q9NS28 235 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 FANCLQ9NW38 375 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 RGL1Q9NZL6 768 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 VAV3Q9UKW4 847 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 PLXNA3P51805 1871 aa6.88□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 A0A087WZ62 844 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 C5orf67F2Z3F1 127 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 HOXA2O43364 376 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 SLC26A4O43511 780 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 RB1P06400 928 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 TMOD1P28289 359 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 UBA7P41226 1012 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 STAT6P42226 847 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 AMPD3Q01432 767 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 CYP4A11Q02928 519 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 STIM1Q13586 685 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 CAMK1Q14012 370 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 KCNB1Q14721 858 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 XKR3Q5GH77 459 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 ISM2Q6H9L7 571 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 POF1BQ8WVV4 589 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 LPPQ93052 612 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 TMEM143Q96AN5 459 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 CEP89Q96ST8 783 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 RAB34Q9BZG1 259 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 EPHX3Q9H6B9 360 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 RNF19AQ9NV58 838 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 PER2O15055 1255 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 ARHGAP6O43182 974 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 ZSCAN12O43309 604 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 TPM1P09493 284 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 OR52Z1P0C646 297 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 ATP1A3P13637 1013 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 BMP6P22004 513 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 LTBRP36941 435 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 AFMP43652 599 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 NRIP1P48552 1158 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 PSMC5P62195 406 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 PPP2R5CQ13362 524 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 TRIM14Q14142 442 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 CLLU1OSQ5K130 101 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 RRAGBQ5VZM2 374 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 CEP135Q66GS9 1140 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 USP49Q70CQ1 688 aa6.87□□□□□ -1.31
MITF-215ENST00000478490 TPH2Q8IWU9 490 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms