RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 DZANK1Q9NVP4 752 aa25.76■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.76■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 GPR37L1O60883 481 aa25.75■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 CNPP09543 421 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 ALADP13716 330 aa25.75■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 DSG1Q02413 1049 aa25.75■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 XKR4Q5GH76 650 aa25.75■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa25.75■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa25.75■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 ADAM7Q9H2U9 754 aa25.75■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 CLIC4Q9Y696 253 aa25.75■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 SFI1A8K8P3 1242 aa25.74■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 THP07101 528 aa25.74■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 SCP2P22307 547 aa25.74■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 GRM5P41594 1212 aa25.74■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM132AQ24JP5 1023 aa25.74■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 LLGL2Q6P1M3 1020 aa25.74■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 TAS1R1Q7RTX1 841 aa25.74■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 PLIN2Q99541 437 aa25.74■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 CDT1Q9H211 546 aa25.74■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 C11orf16Q9NQ32 467 aa25.74■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 F8W810 466 aa25.73■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 URODP06132 367 aa25.73■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 LIG1P18858 919 aa25.73■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 CLCN4P51793 760 aa25.73■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF131P52739 623 aa25.73■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 ALKAL1Q6UXT8 129 aa25.73■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 CXCL16Q9H2A7 254 aa25.73■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 ADAM28Q9UKQ2 775 aa25.73■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 SLC16A4O15374 487 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 DCXO43602 365 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 PAPLNO95428 1278 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 MAPTP10636 758 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 MCF2P10911 925 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 EPCAMP16422 314 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 GLUD2P49448 558 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 SMTNP53814 917 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 NCKAP1LP55160 1127 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 FUT10Q6P4F1 479 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 ZPBP2Q6X784 338 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 RAD54LQ92698 747 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 NECTIN4Q96NY8 510 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 GPR62Q9BZJ7 368 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 H0YCG3 227 aa25.71■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 STX6O43752 255 aa25.71■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 PLCG1P19174 1290 aa25.71■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 KARSQ15046 597 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 RNF135Q8IUD6 432 aa25.71■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.71■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 PAAF1Q9BRP4 392 aa25.71■■□□□ 1.71
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa25.7■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 TOM1L1O75674 476 aa25.7■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.7■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 USP41Q3LFD5 358 aa25.7■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 CES5AQ6NT32 575 aa25.7■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 MPZL3Q6UWV2 235 aa25.7■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 REEP2Q9BRK0 252 aa25.7■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa25.7■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 FNIP2Q9P278 1114 aa25.7■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 GDAQ9Y2T3 454 aa25.7■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 TEX28O15482 410 aa25.69■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 CA8P35219 290 aa25.69■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 DDIT3P35638 169 aa25.69■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 SLC39A14Q15043 492 aa25.69■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF568Q3ZCX4 644 aa25.69■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.69■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 GPBP1Q86WP2 473 aa25.69■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 CEP120Q8N960 986 aa25.69■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 FBXL18Q96ME1 805 aa25.69■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 LRFN3Q9BTN0 628 aa25.69■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.68■■□□□ 1.74e-6■■■■■ 124.1
C9orf3-215ENST00000478473 MYH11P35749 1972 aa25.68■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.68■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 ADH1AP07327 375 aa25.68■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 KLRC2P26717 231 aa25.68■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 MTHFRP42898 656 aa25.68■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 STRN3Q13033 797 aa25.68■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM31Q5JXX7 168 aa25.68■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 KIAA1841Q6NSI8 718 aa25.68■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 USP49Q70CQ1 688 aa25.68■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 HDAC7Q8WUI4 952 aa25.68■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 EPSTI1Q96J88 318 aa25.68■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 USP28Q96RU2 1077 aa25.68■■□□□ 1.7
C9orf3-215ENST00000478473 FIZ1Q96SL8 496 aa25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms