RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		32.15	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		32.15	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	TTC28	Q96AY4	2481 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	PTGES	O14684	152 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	YEATS4	O95619	227 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	RABGGTA	Q92696	567 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	TCHP	Q9BT92	498 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	PARVG	Q9HBI0	331 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	CLEC1B	Q9P126	229 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FBXO18-208	ENST00000470089	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	PPP6R2	O75170	966 aa		32.13	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF131	P52739	623 aa		32.13	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	OSTN	P61366	133 aa		32.13	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	DYM	Q7RTS9	669 aa		32.13	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		32.13	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		32.12	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089		K7ENM7	598 aa		32.12	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	NR1I2	O75469	434 aa		32.12	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	CTSA	P10619	480 aa		32.12	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	STAT6	P42226	847 aa		32.12	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		32.12	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		32.12	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	PDILT	Q8N807	584 aa		32.12	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		32.12	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089		H0YCG3	227 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	ABLIM1	O14639	778 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	PROZ	P22891	400 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	SV2B	Q7L1I2	683 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	CD207	Q9UJ71	328 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	TRAK2	O60296	914 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	TH	P07101	528 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	MCF2	P10911	925 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	GRM5	P41594	1212 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	BICD1	Q96G01	975 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	CIT	O14578	2027 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	MYMK	A6NI61	221 aa		32.09	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	TUSC3	Q13454	348 aa		32.09	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		32.09	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		32.09	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	DDX12P	Q92771	950 aa		32.09	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	MBTPS2	O43462	519 aa		32.08	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	CUTA	O60888	179 aa		32.08	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	TOM1L1	O75674	476 aa		32.08	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	PTPN14	Q15678	1187 aa		32.08	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	ZPBP2	Q6X784	338 aa		32.08	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		32.08	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	FIZ1	Q96SL8	496 aa		32.08	■■■□□ 2.73
FBXO18-208	ENST00000470089	FSD2	A1L4K1	749 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	C2CD2L	O14523	706 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	SOD2	P04179	222 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	32.07	■■■□□ 2.72	8e-7	■■■■□ 23.4
FBXO18-208	ENST00000470089	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNC3	Q14003	757 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	32.07	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	NAB2	Q15742	525 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	SEZ6	Q53EL9	994 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	TBX20	Q9UMR3	447 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	IRAK3	Q9Y616	596 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	C5orf42	Q9H799	3197 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	TNFRSF10A	O00220	468 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	BRD1	O95696	1058 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	SHC4	Q6S5L8	630 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	SFR1	Q86XK3	245 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	HASPIN	Q8TF76	798 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	STK39	Q9UEW8	545 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM50B	Q9Y247	325 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	ME1	P48163	572 aa		32.05	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	LIG4	P49917	911 aa		32.05	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	ATL3	Q6DD88	541 aa		32.05	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		32.05	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	ACAP3	Q96P50	834 aa		32.05	■■■□□ 2.72
FBXO18-208	ENST00000470089	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		32.05	■■■□□ 2.72

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms