RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466373.1

UFD1-206, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 2

Gene UFD1, Length 3,059 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-206	ENST00000466373	PHF2	O75151	1096 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	CAND2	O75155	1236 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	CDR2	Q01850	454 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	MTERF2	Q49AM1	385 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	MICALL2	Q8IY33	904 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	CLDN3	O15551	220 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	ERLIN2	O94905	339 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	GZMA	P12544	262 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	CCND2	P30279	289 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	ACOT2	P49753	483 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	CYP24A1	Q07973	514 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	SNX1	Q13596	522 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	CHADL	Q6NUI6	762 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	CCDC25	Q86WR0	208 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373		A6NNZ2	444 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	PPFIA2	O75334	1257 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	RARA	P10276	462 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	FGFR4	P22455	802 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	PTGIR	P43119	386 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	PMS2	P54278	862 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	WNT7B	P56706	349 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	BACE1	P56817	501 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	PRKCE	Q02156	737 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	GHRHR	Q02643	423 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	PRKG1	Q13976	671 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	TMEM143	Q96AN5	459 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	WRNIP1	Q96S55	665 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	MAPK13	O15264	365 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	TNNI1	P19237	187 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	CHRNA3	P32297	505 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	SLCO1A2	P46721	670 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	GPC3	P51654	580 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	PPP2R2A	P63151	447 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	BIRC3	Q13489	604 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	SLC29A2	Q14542	456 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	CD101	Q93033	1021 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	PNMA2	Q9UL42	364 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	KCNA2	P16389	499 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	PDE4C	Q08493	712 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	EMC10	Q5UCC4	262 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	PASD1	Q8IV76	773 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	GPD1L	Q8N335	351 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	PPM1E	Q8WY54	764 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	ZNF516	Q92618	1163 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	KIFAP3	Q92845	792 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	PIM2	Q9P1W9	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	WDR81	Q562E7	1941 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	FAM187A	A6NFU0	413 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	GRIN3B	O60391	1043 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	ZBTB7A	O95365	584 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	CTNNA2	P26232	953 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	LIG4	P49917	911 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	ACTR2	P61160	394 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	PPP2R5E	Q16537	467 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	SEZ6	Q53EL9	994 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-206	ENST00000466373	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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