RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 KRBA1A5PL33 1030 aa25.06■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 POTEMA6NI47 508 aa25.06■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 TADA2AO75478 443 aa25.06■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.06■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 MAEAQ7L5Y9 396 aa25.06■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 NXPE3Q969Y0 559 aa25.06■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 PAAF1Q9BRP4 392 aa25.06■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 PRKD2Q9BZL6 878 aa25.06■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.06■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 PIDD1Q9HB75 910 aa25.06■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
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USP4-208ENST00000464168 ANGPT1Q15389 498 aa25.05■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 FZD8Q9H461 694 aa25.05■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 DOCK8Q8NF50 2099 aa25.05■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 JAK2O60674 1132 aa25.04■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 LAMP2P13473 410 aa25.04■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 FOSBP53539 338 aa25.04■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 RTP2Q5QGT7 225 aa25.04■■□□□ 1.6
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USP4-208ENST00000464168 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 CATSPER3Q86XQ3 398 aa25.04■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.04■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 STK25O00506 426 aa25.03■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 ZMYND10O75800 440 aa25.03■■□□□ 1.6
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USP4-208ENST00000464168 TUSC3Q13454 348 aa25.03■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 FAM187BQ17R55 369 aa25.03■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 MCPH1Q8NEM0 835 aa25.03■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 ANHXE9PGG2 379 aa25.02■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 PTGESO14684 152 aa25.02■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 MED24O75448 989 aa25.02■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 ATP2B1P20020 1258 aa25.02■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 HASPINQ8TF76 798 aa25.02■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 CLSTN3Q9BQT9 956 aa25.02■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 CXCL16Q9H2A7 254 aa25.02■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 PDZD7Q9H5P4 517 aa25.02■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 TUFT1Q9NNX1 390 aa25.02■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 CA14Q9ULX7 337 aa25.02■■□□□ 1.6
USP4-208ENST00000464168 CASTOR2A6NHX0 329 aa25.01■■□□□ 1.59
USP4-208ENST00000464168 HTR4Q13639 388 aa25.01■■□□□ 1.59
USP4-208ENST00000464168 TRIM29Q14134 588 aa25.01■■□□□ 1.59
USP4-208ENST00000464168 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa25.01■■□□□ 1.59
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USP4-208ENST00000464168 NACC1Q96RE7 527 aa25.01■■□□□ 1.59
USP4-208ENST00000464168 TTPALQ9BTX7 342 aa25.01■■□□□ 1.59
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USP4-208ENST00000464168 TBC1D17Q9HA65 648 aa25■■□□□ 1.59
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USP4-208ENST00000464168 THP07101 528 aa24.99■■□□□ 1.59
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USP4-208ENST00000464168 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa24.98■■□□□ 1.59
USP4-208ENST00000464168 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
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USP4-208ENST00000464168 ACKR2O00590 384 aa24.97■■□□□ 1.59
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USP4-208ENST00000464168 EDN1P05305 212 aa24.97■■□□□ 1.59
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USP4-208ENST00000464168 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
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USP4-208ENST00000464168 RPA1P27694 616 aa24.97■■□□□ 1.59
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