RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ZPBP2Q6X784 338 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SV2AQ7L0J3 742 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CTAGE6Q86UF2 777 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GPD1LQ8N335 351 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 RUBCNQ92622 972 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM143Q96AN5 459 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SAAL1Q96ER3 474 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FAM167AQ96KS9 214 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SPAG5Q96R06 1193 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHB18PQ96TA0 734 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 OGFRQ9NZT2 677 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 L1RE1Q9UN81 338 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC169A6NNP5 214 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 BTBD19C9JJ37 291 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PALMO75781 387 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TUBBP07437 444 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 H2AFZP0C0S5 128 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CYP2C8P10632 490 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 OSBPP22059 807 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TNFRSF8P28908 595 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SLC26A2P50443 739 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 STAT5BP51692 787 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GALCP54803 685 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 VSNL1P62760 191 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FMO1Q01740 532 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GCNT1Q02742 428 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ARID5AQ03989 594 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 POU5F1BQ06416 359 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GRM1Q13255 1194 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 LY6KQ17RY6 165 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 KRT39Q6A163 491 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 H2AFVQ71UI9 128 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM50Q86XT4 487 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 RDH13Q8NBN7 331 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 RFFLQ8WZ73 363 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 HES6Q96HZ4 224 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MMP19Q99542 508 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 AGPAT1Q99943 283 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 DEF6Q9H4E7 631 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 RNF14Q9UBS8 474 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 TSKSQ9UJT2 592 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 COG5Q9UP83 839 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ASB14A6NK59 587 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 BUB1O43683 1085 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SORBS3O60504 671 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 KIF4AO95239 1232 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 C22orf31O95567 290 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CETPP11597 493 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GZMAP12544 262 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF132P52740 706 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 SP4Q02446 784 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms