RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 RPA1P27694 616 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 DSG1Q02413 1049 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 DSC1Q08554 894 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 TCF15Q12870 199 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 TDGQ13569 410 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 NBR1Q14596 966 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP2R5AQ15172 486 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 HAUS3Q68CZ6 603 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 RSAD2Q8WXG1 361 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 BSNDQ8WZ55 320 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 PAAF1Q9BRP4 392 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 TCHPQ9BT92 498 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 RAB34Q9BZG1 259 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 KCNK12Q9HB15 430 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 CITO14578 2027 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 K7ERI5 159 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 TGM5O43548 720 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 RECQL4O94761 1208 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 CFHP08603 1231 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 OSTNP61366 133 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 ST3GAL1Q11201 340 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 TUSC3Q13454 348 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 SIX5Q8N196 739 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 TTPALQ9BTX7 342 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 FZD8Q9H461 694 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 PDZD7Q9H5P4 517 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 RXFP1Q9HBX9 757 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 CA14Q9ULX7 337 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 DNM3Q9UQ16 869 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 CLUHO75153 1309 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 E9PMD0 336 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 ACKR2O00590 384 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 NARSO43776 548 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 GFRA3O60609 400 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 NAMPTP43490 491 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 YARSP54577 528 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 PEX3P56589 373 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 CREMQ03060 361 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 PTGDRQ13258 359 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 PSMD5Q16401 504 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 ECM1Q16610 540 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 PPM1LQ5SGD2 360 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 LIN9Q5TKA1 542 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 ATF7IP2Q5U623 682 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 KRT79Q5XKE5 535 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM105Q8N8V8 129 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 GSTCDQ8NEC7 633 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 KIFAP3Q92845 792 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 PLIN2Q99541 437 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 CXCL16Q9H2A7 254 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 CHST7Q9NS84 486 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 IGSF9Q9P2J2 1179 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 VWA8A3KMH1 1905 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 SFI1A8K8P3 1242 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 PP2D1A8MPX8 630 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 H3BQV1 296 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 I3L4J1 428 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 CCL16O15467 120 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 B3GAT3O94766 335 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 KIF4AO95239 1232 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 FSHRP23945 695 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 CDC25AP30304 524 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 OR1D2P34982 312 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 EFNA5P52803 228 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 ARPP19P56211 112 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-204ENST00000459646 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.42□□□□□ -0.9
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