RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TAS1R1Q7RTX1 841 aa17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RABGGTAQ92696 567 aa17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAD54LQ92698 747 aa17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP28Q96RU2 1077 aa17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 REEP2Q9BRK0 252 aa17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COLEC11Q9BWP8 271 aa17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APOL5Q9BWW9 433 aa17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCSER1Q9C0I3 900 aa17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDT1Q9H211 546 aa17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 S1PR5Q9H228 398 aa17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTPRHQ9HD43 1115 aa17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CACNG4Q9UBN1 327 aa17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C2CD2LO14523 706 aa17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LILRB3O75022 631 aa17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EFEMP2O95967 443 aa17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 THP07101 528 aa17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF568Q3ZCX4 644 aa17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CEP120Q8N960 986 aa17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SUSD6Q92537 303 aa17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLIC6Q96NY7 704 aa17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PAAF1Q9BRP4 392 aa17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EPHX3Q9H6B9 360 aa17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNG1Q9UIX4 513 aa17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ODF2LQ9ULJ1 636 aa17.09■□□□□ 0.33
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CASTOR2A6NHX0 329 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABLIM1O14639 778 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 URODP06132 367 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNPP09543 421 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAPTP10636 758 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EPCAMP16422 314 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PROZP22891 400 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GRM5P41594 1212 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GLUD2P49448 558 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STRN3Q13033 797 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TUSC3Q13454 348 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAB2Q15742 525 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FUT10Q6P4F1 479 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZBTB33Q86T24 672 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC22A17Q8WUG5 538 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLHL5Q96PQ7 755 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR62Q9BZJ7 368 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADAM28Q9UKQ2 775 aa17.08■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM13AO94988 1023 aa17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRT18P05783 430 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MCF2P10911 925 aa17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NCKAP1LP55160 1127 aa17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OSTNP61366 133 aa17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC39A14Q15043 492 aa17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TPRNQ4KMQ1 711 aa17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GLRA4Q5JXX5 417 aa17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MPZL3Q6UWV2 235 aa17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TCHPQ9BT92 498 aa17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDH22Q9UJ99 828 aa17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYH15Q9Y2K3 1946 aa17.07■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 H0YCG3 227 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TADA2AO75478 443 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIF4AO95239 1232 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BRD1O95696 1058 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HARSP12081 509 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLRC2P26717 231 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DDIT3P35638 169 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NASPP49321 788 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLCN4P51793 760 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF131P52739 623 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DSG1Q02413 1049 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIAA0319Q5VV43 1072 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPFIBP1Q86W92 1011 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYCT1Q8N699 235 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HASPINQ8TF76 798 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 B3GALT6Q96L58 329 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PARVGQ9HBI0 331 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHST7Q9NS84 486 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DZANK1Q9NVP4 752 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC39Q9UFE4 941 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa17.06■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PI4K2BG5E9Z4 385 aa17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms