RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INVSQ9Y283 1065 aa9.93□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYH2Q9UKX2 1941 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FKTNO75072 461 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AMY2AP04746 511 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASGR2P07307 311 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GNAT1P11488 350 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRT15P19012 456 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC9A1P19634 815 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AMY2BP19961 511 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BTDP43251 543 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPR3P46089 330 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCP10Q12799 353 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NFIAQ12857 509 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRM1Q13255 1194 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MORC3Q14149 939 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 THAP5Q7Z6K1 395 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTC17Q96AE7 1141 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM169Q96HH4 297 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFB129Q9H1M3 183 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TOMM22Q9NS69 142 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USP40Q9NVE5 1235 aa9.92□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAST3O60307 1309 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANO9A1A5B4 782 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP5JP18859 108 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRM3Q14832 879 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CMIPQ8IY22 773 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8N1Y9 231 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GCC1Q96CN9 775 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRGUKQ96M69 825 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 JAM3Q9BX67 310 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MKNK2Q9HBH9 465 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DUSP13Q9UII6 198 aa9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNTNAP1P78357 1384 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GAKO14976 1311 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SSC5DA1L4H1 1573 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DVL2O14641 736 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIP1RO75146 1068 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NKPD1Q17RQ9 610 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL31Q6EBC2 164 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FRMD7Q6ZUT3 714 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DPF3Q92784 378 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACSS2Q9NR19 701 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAN1C1Q9NR34 630 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.9□□□□□ -0.82
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRPM7Q96QT4 1865 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM82A0PJX8 343 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WFS1O76024 890 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MX1P20591 662 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AKAP5P24588 427 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RGS3P49796 1198 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLCN7P51798 805 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIF11P52732 1056 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OXCT1P55809 520 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUCB1Q02818 461 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLUL1Q15846 466 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEP68Q76N32 757 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHD1LQ86WJ1 897 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZZZ3Q8IYH5 903 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TEKT5Q96M29 485 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPB41L1Q9H4G0 881 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.89□□□□□ -0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms