RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451422.1

ANKRD28-204, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 2,485 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-204ENST00000451422 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa8.1□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM51Q9NW97 253 aa8.1□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 HACL1Q9UJ83 578 aa8.1□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.1□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 TLDC2A0PJX2 215 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 PEX10O60683 326 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 PHF2O75151 1096 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 CCND2P30279 289 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 SFNP31947 248 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 MAGEA9P43362 315 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 RPL21P46778 160 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 PDE6CP51160 858 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 GHRHRQ02643 423 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 CYP24A1Q07973 514 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 MTMR3Q13615 1198 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 MTERF2Q49AM1 385 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 ZDHHC24Q6UX98 284 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 MICALL2Q8IY33 904 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 CCT8L2Q96SF2 557 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 ANKEF1Q9NU02 776 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 RAB20Q9NX57 234 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 PPFIA2O75334 1257 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 PTGIRP43119 386 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 HADHBP55084 474 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 CDR2Q01850 454 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 SNX1Q13596 522 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 TNFAIP1Q13829 316 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 NLRP14Q86W24 1093 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 MDM1Q8TC05 714 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-204ENST00000451422 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 MAPK13O15264 365 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 CLDN3O15551 220 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 CAND2O75155 1236 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 ERLIN2O94905 339 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 RARAP10276 462 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 GZMAP12544 262 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 KCNA2P16389 499 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 FGFR4P22455 802 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 ACOT2P49753 483 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 GPC3P51654 580 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 PMS2P54278 862 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 WNT7BP56706 349 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 PRKCEQ02156 737 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.129e-8■■■■□ 24
ANKRD28-204ENST00000451422 PRKG1Q13976 671 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 CHADLQ6NUI6 762 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 OTUD6AQ7L8S5 288 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 PACS2Q86VP3 889 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 CCDC25Q86WR0 208 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF516Q92618 1163 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 CD101Q93033 1021 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM143Q96AN5 459 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 WRNIP1Q96S55 665 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 TIPINQ9BVW5 301 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 EPB41L4BQ9H329 900 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 PIM2Q9P1W9 311 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM187AA6NFU0 413 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 A6NNZ2 444 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 GRIN3BO60391 1043 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 STBD1O95210 358 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 CYP1A2P05177 515 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 TNNI1P19237 187 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 CHRNA3P32297 505 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 SLCO1A2P46721 670 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 BACE1P56817 501 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 ACTR2P61160 394 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 PPP2R2AP63151 447 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD28-204ENST00000451422 BIRC3Q13489 604 aa8.08□□□□□ -1.12
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