RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	P2RX5	Q93086	422 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	YME1L1	Q96TA2	773 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RSAD1	Q9HA92	442 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF19A	Q9NV58	838 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	DACH1	Q9UI36	760 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		14.93	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	HOXA2	O43364	376 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	EXOC3	O60645	756 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	DGKI	O75912	1065 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GJB5	O95377	273 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	NR3C1	P04150	777 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLTA	P09496	248 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCNE1	P24864	410 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	MLH1	P40692	756 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RABGGTB	P53611	331 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	PAK1	Q13153	545 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	KYAT1	Q16773	422 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CEP135	Q66GS9	1140 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPD1L	Q8N335	351 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GAD1	Q99259	594 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANO10	Q9NW15	660 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	BICDL2	A1A5D9	508 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARL5C	A6NH57	179 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	EXTL3	O43909	919 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CXCL8	P10145	99 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	NR2F2	P24468	414 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TYRO3	Q06418	890 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADAM9	Q13443	819 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	STX1A	Q16623	288 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZFP42	Q96MM3	310 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	INSL6	Q9Y581	213 aa		14.92	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TTC3	P53804	2025 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF233	A6NK53	670 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM189A1	O60320	539 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	OFD1	O75665	1012 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	POMC	P01189	267 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC192	P0DO97	292 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRC63	Q05C16	580 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	URGCP	Q8TCY9	931 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CASD1	Q96PB1	797 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAD9A	Q99638	391 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRO3102	Q9H379	93 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		14.91	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CETN3	O15182	167 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCNN1G	P51170	649 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		14.9	□□□□□ -0.02
SELENBP1-208	ENST00000447402	LACTBL1	A8MY62	500 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYOG	P15173	224 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CASP4	P49662	377 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPAG1	Q07617	926 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		14.89	□□□□□ -0.03

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms