RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423941.5

HDAC6-205, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-205ENST00000423941 LIG4P49917 911 aa20.2■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 PSMD2Q13200 908 aa20.2■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 NAB2Q15742 525 aa20.2■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.2■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 URGCPQ8TCY9 931 aa20.2■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 MYLIPQ8WY64 445 aa20.2■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 ACCSQ96QU6 501 aa20.2■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 TCHPQ9BT92 498 aa20.2■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.2■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.2■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 CARNS1A5YM72 827 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 PRR29P0C7W0 189 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 ADSSP30520 456 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 CTNNB1P35222 781 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 UBE2HP62256 183 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 ZBTB33Q86T24 672 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 SPATA20Q8TB22 786 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 APOL6Q9BWW8 343 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 AAASQ9NRG9 546 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 PARP2Q9UGN5 583 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa20.19■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 OGTO15294 1046 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 RHOBTB3O94955 611 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 ITGB1P05556 798 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 GALTP07902 379 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 SCNN1GP51170 649 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 BCAR1P56945 870 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 PLCB3Q01970 1234 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 GPM6BQ13491 265 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 CAMK1Q14012 370 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 KCNB1Q14721 858 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 KYAT1Q16773 422 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 BICD1Q96G01 975 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 TMEM206Q9H813 350 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 KLK14Q9P0G3 267 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.18■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 TISP43B9A030 160 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 POMCP01189 267 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 GRIK3Q13003 919 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 STK4Q13043 487 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 POSTNQ15063 836 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 ZNF558Q96NG5 402 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 ACAP3Q96P50 834 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 GDAQ9Y2T3 454 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 UBE4BO95155 1302 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 ANK1P16157 1881 aa20.17■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 TTC26A0AVF1 554 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 GRM6O15303 877 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 EFEMP2O95967 443 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 CLTAP09496 248 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 KCNE1P15382 129 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 UBE3AQ05086 875 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 SNX27Q96L92 541 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 SPG21Q9NZD8 308 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 CNTN3Q9P232 1028 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 LZTS1Q9Y250 596 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 COL6A3P12111 3177 aa20.16■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.15■□□□□ 0.82
HDAC6-205ENST00000423941 TGFB1I1O43294 461 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms