RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LIG4P49917 911 aa13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NCKAP1LP55160 1127 aa13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADAM15Q13444 863 aa13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIAA1841Q6NSI8 718 aa13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZPBP2Q6X784 338 aa13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 COLGALT2Q8IYK4 626 aa13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ACAP3Q96P50 834 aa13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MIOSQ9NXC5 875 aa13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM13BQ9NYF5 915 aa13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TADA2AO75478 443 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EDN1P05305 212 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CTSAP10619 480 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BMP1P13497 986 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IDEP14735 1019 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GRM5P41594 1212 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF131P52739 623 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OSTNP61366 133 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AMPD3Q01432 767 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TUSC3Q13454 348 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PKP1Q13835 747 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DUSP6Q16828 381 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CTC1Q2NKJ3 1217 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IQUBQ8NA54 791 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DDX12PQ92771 950 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDT1Q9H211 546 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 XIRP2A4UGR9 3374 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HIDE1A8MVS5 230 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LINC01565O15544 149 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 URODP06132 367 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GAP43P17677 238 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRT85P78386 507 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DSC1Q08554 894 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 COL19A1Q14993 1142 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLUL1Q15846 466 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KYAT1Q16773 422 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LLGL2Q6P1M3 1020 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TAS1R3Q7RTX0 852 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRRC15Q8TF66 581 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZBP1Q9H171 429 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CUEDC2Q9H467 287 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SEL1LQ9UBV2 794 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD207Q9UJ71 328 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TBX20Q9UMR3 447 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C2orf71A6NGG8 1288 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CASTOR2A6NHX0 329 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 B4GALT3O60512 393 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BRD1O95696 1058 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SOD2P04179 222 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PPFIBP1Q86W92 1011 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC65Q8IXS2 484 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GSTCDQ8NEC7 633 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AUTS2Q8WXX7 1259 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CASP10Q92851 521 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DHX58Q96C10 678 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPATA32Q96LK8 384 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PTPRHQ9HD43 1115 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC38A7Q9NVC3 462 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADAM28Q9UKQ2 775 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EXOC7Q9UPT5 735 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CITO14578 2027 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GRXCR2A6NFK2 248 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYMKA6NI61 221 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C2CD2LO14523 706 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PTGESO14684 152 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TBX10O75333 385 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PROZP22891 400 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KLRC2P26717 231 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NMT1P30419 496 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LTBRP36941 435 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GLUD2P49448 558 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 USP41Q3LFD5 358 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GLRA4Q5JXX5 417 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FUT10Q6P4F1 479 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SHC4Q6S5L8 630 aa13.57□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SFR1Q86XK3 245 aa13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms