RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GBP4Q96PP9 640 aa16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM175Q9BSA9 504 aa16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CERS4Q9HA82 394 aa16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STK39Q9UEW8 545 aa16.72■□□□□ 0.27
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLRC4O43908 158 aa16.71■□□□□ 0.27
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF20AO95235 890 aa16.71■□□□□ 0.27
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLTAP09496 248 aa16.71■□□□□ 0.27
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTPROQ16827 1216 aa16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XKR4Q5GH76 650 aa16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNT2Q6UVM3 1135 aa16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBTB33Q86T24 672 aa16.71■□□□□ 0.27
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GSTCDQ8NEC7 633 aa16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSPAN18Q96SJ8 248 aa16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16.71■□□□□ 0.27
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 NR1I2O75469 434 aa16.7■□□□□ 0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLCB3Q01970 1234 aa16.7■□□□□ 0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPM6BQ13491 265 aa16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BMT2Q1RMZ1 405 aa16.7■□□□□ 0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPRED2Q7Z698 418 aa16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 THNSL1Q8IYQ7 743 aa16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RMND1Q9NWS8 449 aa16.7■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPG21Q9NZD8 308 aa16.7■□□□□ 0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa16.7■□□□□ 0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP16.69■□□□□ 0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.69■□□□□ 0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLHL23Q8NBE8 558 aa16.69■□□□□ 0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNX27Q96L92 541 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GSDMAQ96QA5 445 aa16.69■□□□□ 0.26
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC38A7Q9NVC3 462 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNTN3Q9P232 1028 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLAGL2Q9UPG8 496 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MICAL3Q7RTP6 2002 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM189A1O60320 539 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FGF18O76093 207 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMC2O95347 1197 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GALTP07902 379 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNA1Q09470 495 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TUSC3Q13454 348 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADGRE1Q14246 886 aa16.68■□□□□ 0.26
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