RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396667.7

TMEM106B-201, Transcript of transmembrane protein 106B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM106B, Length 12,539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106B-201ENST00000396667 C16orf86Q6ZW13 317 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KLRG1Q96E93 195 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SENP2Q9HC62 589 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 IFNKQ9P0W0 207 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TRIM10Q9UDY6 481 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CDY2AQ9Y6F7 541 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SLC12A8A0AV02 714 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ALDH3A1P30838 453 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 NEDD1Q8NHV4 660 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 EPSTI1Q96J88 318 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KRT12Q99456 494 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TRIM62Q9BVG3 475 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KLHL3Q9UH77 587 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PLCG1P19174 1290 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SDC4P31431 198 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 THOP1P52888 689 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 COG7P83436 770 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ELF2Q15723 593 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 IQSEC1Q6DN90 963 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SUSD6Q92537 303 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 OMDQ99983 421 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ESPNB1AK53 854 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 LAMTOR5O43504 91 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 RASGRP1O95267 797 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 AMD1P17707 334 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 MXI1P50539 228 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PDE1BQ01064 536 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 DRP2Q13474 957 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PTPN14Q15678 1187 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SLC39A12Q504Y0 691 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 UBXN4Q92575 508 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 UNC45AQ9H3U1 944 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PDGFCQ9NRA1 345 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SNTG2Q9NY99 539 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PTPN22Q9Y2R2 807 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TULP4Q9NRJ4 1543 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PP2D1A8MPX8 630 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 A8MX80 341 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 NVLO15381 856 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 HSF2BPO75031 334 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 WASHC5Q12768 1159 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PDIA6Q15084 440 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 LRRC7Q96NW7 1537 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PDZK1P1A8MUH7 402 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PFKFB2O60825 505 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KRT15P19012 456 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 RASA1P20936 1047 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 NNTQ13423 1086 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CEP55Q53EZ4 464 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SGO2Q562F6 1265 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 AUTS2Q8WXX7 1259 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CASS4Q9NQ75 786 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 APPL1Q9UKG1 709 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.73□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KCNJ18B7U540 433 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 RPN1P04843 607 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TNNI3P19429 210 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 MAGEA1P43355 309 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SLC11A2P49281 568 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KCNJ12Q14500 433 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ADCK5Q3MIX3 580 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 DACT2Q5SW24 774 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CHPFQ8IZ52 775 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ZDHHC15Q96MV8 337 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 RIC8AQ9NPQ8 531 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 HPS4Q9NQG7 708 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 INVSQ9Y283 1065 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CYB561D2O14569 222 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 NCAM1P13591 858 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 LAG3P18627 525 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PCSK1P29120 753 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 NUDCD1Q96RS6 583 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SMC6Q96SB8 1091 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 MYO1FO00160 1098 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PPP3CCP48454 512 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TMC5Q6UXY8 1006 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KIFC3Q9BVG8 833 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 GFPT2O94808 682 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 FSBPO95073 299 aa4.72□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PFKFB1P16118 471 aa4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms