RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC39A14Q15043 492 aa22.61■■□□□ 1.21
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UBE2E3-201ENST00000392415 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 GPBP1Q86WP2 473 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 CASP10Q92851 521 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 REEP2Q9BRK0 252 aa22.61■■□□□ 1.21
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UBE2E3-201ENST00000392415 DDIT3P35638 169 aa22.6■■□□□ 1.21
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UBE2E3-201ENST00000392415 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.6■■□□□ 1.21
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UBE2E3-201ENST00000392415 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.6■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 F8W810 466 aa22.59■■□□□ 1.21
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UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF131P52739 623 aa22.59■■□□□ 1.21
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UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 SUSD6Q92537 303 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 CLIC6Q96NY7 704 aa22.59■■□□□ 1.21
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UBE2E3-201ENST00000392415 ABLIM1O14639 778 aa22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 BRD1O95696 1058 aa22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 GRM5P41594 1212 aa22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP120Q8N960 986 aa22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.218e-7■■■□□ 17.6
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UBE2E3-201ENST00000392415 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 CHST7Q9NS84 486 aa22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.58■■□□□ 1.21
UBE2E3-201ENST00000392415 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.58■■□□□ 1.21
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UBE2E3-201ENST00000392415 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 ZPBP2Q6X784 338 aa22.57■■□□□ 1.2
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UBE2E3-201ENST00000392415 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.57■■□□□ 1.2
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UBE2E3-201ENST00000392415 TCHPQ9BT92 498 aa22.57■■□□□ 1.2
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UBE2E3-201ENST00000392415 STK17AQ9UEE5 414 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 TOM1L1O75674 476 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM13AO94988 1023 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 SCP2P22307 547 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 TXLNAP40222 546 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 DSG1Q02413 1049 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 XKR4Q5GH76 650 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB33Q86T24 672 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR65Q8IYL9 337 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 RABGGTAQ92696 567 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIOO75962 3097 aa22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 C2CD2LO14523 706 aa22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 TADA2AO75478 443 aa22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 EPCAMP16422 314 aa22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 GLUD2P49448 558 aa22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 USP41Q3LFD5 358 aa22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 MYCT1Q8N699 235 aa22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
UBE2E3-201ENST00000392415 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.56■■□□□ 1.2
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