RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375150.6

PRRT1-202, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,726 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 FNBP1Q96RU3 617 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 CLTAP09496 248 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 GHRP10912 638 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 PAK2Q13177 524 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 SEZ6Q53EL9 994 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 PITPNM1O00562 1244 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 NPTXRO95502 500 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 SELPP16109 830 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 TNFSF9P41273 254 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 LPIN1Q14693 890 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 SYCP1Q15431 976 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 SURF1Q15526 300 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 TRIM60Q495X7 471 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 CHST12Q9NRB3 414 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 IMPACTQ9P2X3 320 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 STAG3L1P0CL83 205 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 GTF2H1P32780 548 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 FMO5P49326 533 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 OSTNP61366 133 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 DLG4P78352 724 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 PTPN21Q16825 1174 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 CEP120Q8N960 986 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 IL18RAPO95256 599 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 CD52P31358 61 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 GRM5P41594 1212 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 MYL7Q01449 175 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 TLE2Q04725 743 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 CETN1Q12798 172 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 PADI3Q9ULW8 664 aa20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
PRRT1-202ENST00000375150 P4HA2O15460 535 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 MXI1P50539 228 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 TRIM14Q14142 442 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 GBP6Q6ZN66 633 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 ACAP3Q96P50 834 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 CGRRF1Q99675 332 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 CITO14578 2027 aa20.51■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 TPM1P09493 284 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 TNNI1P19237 187 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 GCLMP48507 274 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 CLDN10P78369 228 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 PPP3CAQ08209 521 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 IQCDQ96DY2 449 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 ANK1P16157 1881 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 PMM2O15305 246 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 CXCL8P10145 99 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 FAAP100Q0VG06 881 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 CBWD6Q4V339 395 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 FAM212AQ96EL1 285 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 NUP58Q9BVL2 599 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 HIPK3Q9H422 1215 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 GCNT4Q9P109 453 aa20.5■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 AP3M2P53677 418 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 GSDMDP57764 484 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 MBTPS1Q14703 1052 aa20.49■□□□□ 0.87
PRRT1-202ENST00000375150 UBXN11Q5T124 520 aa20.49■□□□□ 0.87
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