RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356455.8

UBE2C-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2C, Length 850 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-204ENST00000356455 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 ACACBO00763 2458 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 LILRB5O75023 590 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 GRIK3Q13003 919 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 XKR9Q5GH70 373 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 HASPINQ8TF76 798 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 NELL2Q99435 816 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 MTRQ99707 1265 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 KLK14Q9P0G3 267 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 PARP2Q9UGN5 583 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 RAB23Q9ULC3 237 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 NID2Q14112 1375 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2C-204ENST00000356455 IFNAR1P17181 557 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 YWHABP31946 246 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 PTENP60484 403 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 PPP2R5CQ13362 524 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 TFDP1Q14186 410 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 NTRK3Q16288 839 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 PSMD5Q16401 504 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 CLDN23Q96B33 292 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 TTPALQ9BTX7 342 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 SLC37A4O43826 429 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 NPTXRO95502 500 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 ADRB1P08588 477 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 BLIDQ8IZY5 108 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 ING5Q8WYH8 240 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 NELL1Q92832 810 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 LXNQ9BS40 222 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 PARD6AQ9NPB6 346 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 VAV3Q9UKW4 847 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 MARCH6O60337 910 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 HOXA9P31269 272 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 LPAL2Q16609 132 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 INF2Q27J81 1249 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 C4orf19Q8IY42 314 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.42■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 TGM1P22735 817 aa20.42■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.42■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 SPEM2Q0P670 501 aa20.42■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 MTAPQ13126 283 aa20.42■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.42■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 FAM20AQ96MK3 541 aa20.42■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.42■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 RGL1Q9NZL6 768 aa20.42■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.42■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 B4GALT5O43286 388 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 ADCY1Q08828 1119 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 TUSC3Q13454 348 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 EPHA7Q15375 998 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 PPM1JQ5JR12 505 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 DYDC2Q96IM9 177 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 ZBTB39O15060 712 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 ADAM12O43184 909 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 ECI2O75521 394 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 KIF4AO95239 1232 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 KCNA4P22459 653 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 NRLP54845 237 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2C-204ENST00000356455 CYP4A11Q02928 519 aa20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms