RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354241.5

TRIM4-202, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 1,942 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-202ENST00000354241 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.26■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.26■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 LMO3Q8TAP4 145 aa22.26■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.26■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 CPB2Q96IY4 423 aa22.26■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.26■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.26■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 PMM2O15305 246 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 ERLIN2O94905 339 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 NDUFA10O95299 355 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 TNNI1P19237 187 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 CDC42EP1Q00587 391 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 FAM189A1O60320 539 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 GPR32O75388 356 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 ARID5AQ03989 594 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 ASIC2Q16515 512 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 CDT1Q9H211 546 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 TSKSQ9UJT2 592 aa22.25■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 LRRN2O75325 713 aa22.24■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 ASGR1P07306 291 aa22.24■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 FGFR4P22455 802 aa22.24■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 KCNA10Q16322 511 aa22.24■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 SV2AQ7L0J3 742 aa22.24■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.24■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.24■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 FAM84AQ96KN4 292 aa22.24■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 CCDC42Q96M95 316 aa22.24■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 OSMRQ99650 979 aa22.24■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 TSPAN1O60635 241 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 HOXC8P31273 242 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 OSTNP61366 133 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 PTPN14Q15678 1187 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF516Q92618 1163 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 FAM212AQ96EL1 285 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 DEF6Q9H4E7 631 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 MYO6Q9UM54 1294 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 INHAP05111 366 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 SERPING1P05155 500 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 JAM2P57087 298 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 CLDN10P78369 228 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 SEMA4DQ92854 862 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 CGRRF1Q99675 332 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.23■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 PTPRJQ12913 1337 aa22.22■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 HGSNATQ68CP4 663 aa22.22■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.22■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 CEP120Q8N960 986 aa22.22■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 RAB20Q9NX57 234 aa22.22■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.22■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 TNNT1P13805 278 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 RFX1P22670 979 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 PRMT2P55345 433 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 STK33Q9BYT3 514 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 ANK1P16157 1881 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 MCF2P10911 925 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 STAT1P42224 750 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 BIRC3Q13489 604 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 RNF180Q86T96 592 aa22.21■■□□□ 1.15
TRIM4-202ENST00000354241 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms