RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 12
PTPRU-201ENST00000345512 ATP8B4Q8TF62 1192 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 NSMCE1Q8WV22 266 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 MAML1Q92585 1016 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 KCND2Q9NZV8 630 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 GNA15P30679 374 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 PPP2R5DQ14738 602 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 RASIP1Q5U651 963 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ERICH1Q86X53 443 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 KCTD6Q8NC69 237 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 GJA3Q9Y6H8 435 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 FAM86B1E9PN63 330 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 LCA5LO95447 670 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 FAM86B2P0C5J1 330 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ARL4CP56559 192 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 NIM1KQ8IY84 436 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 FUKQ8N0W3 1084 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 MASTLQ96GX5 879 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 OLFML3Q9NRN5 406 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 GTF3C4Q9UKN8 822 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SKIP12755 728 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 PRKCIP41743 596 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 FNTAP49354 379 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 JAK3P52333 1124 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 PSMC5P62195 406 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 NOL4O94818 638 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 UBOX5O94941 541 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 APBA3O96018 575 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SCFD2Q8WU76 684 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 RPS6KC1Q96S38 1066 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRU-201ENST00000345512 FAM47DPA6NHR8 397 aa16.52■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SHMT1P34896 483 aa16.52■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 RPL21P46778 160 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ITIH4Q14624 930 aa16.52■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC14Q49A88 953 aa16.52■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 C2CD6Q53TS8 623 aa16.52■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 KIRREL3Q8IZU9 778 aa16.52■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PI4K2AQ9BTU6 479 aa16.52■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PSMA2P25787 234 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SLC1A1P43005 524 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 COPS2P61201 443 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 OSTNP61366 133 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SERPINB12Q96P63 405 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 GABBR1Q9UBS5 961 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CFAP69A5D8W1 941 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ASNSP08243 561 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 AADACL2Q6P093 401 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ANKMY2Q8IV38 441 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 MCPH1Q8NEM0 835 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 OSBPL8Q9BZF1 889 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 GOLGA8RI6L899 631 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ZBTB39O15060 712 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PSAPP07602 524 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 FLT3P36888 993 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CDR2Q01850 454 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM35BQ8NCS4 154 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 KCTD10Q9H3F6 313 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 UBE4BO95155 1302 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SHBGP04278 402 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 MYBL1P10243 752 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 DNAJC3Q13217 504 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 AP1ARQ63HQ0 302 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 TUBB6Q9BUF5 446 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SCOCQ9UIL1 159 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 FEM1BQ9UK73 627 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 MYO3BQ8WXR4 1341 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 OPHN1O60890 802 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 HAUS5O94927 633 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 RALAP11233 206 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CCND1P24385 295 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 RHBDL3P58872 404 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 KRT76Q01546 638 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CBWD6Q4V339 395 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CBWD3Q5JTY5 395 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CBWD5Q5RIA9 395 aa16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms