RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340157.8

VRK2-201, Transcript of vaccinia related kinase 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VRK2, Length 1,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK2-201ENST00000340157 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.98■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 BRCA2P51587 3418 aa22.97■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.97■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 RCCD1A6NED2 376 aa22.97■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 F8VZ95 297 aa22.97■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 GJA9P57773 515 aa22.97■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 CETN1Q12798 172 aa22.97■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.97■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.97■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.97■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 MAP7D2Q96T17 732 aa22.97■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 STK33Q9BYT3 514 aa22.97■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 ELNP15502 786 aa22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 USP37Q86T82 979 aa22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 ZNF592Q92610 1267 aa22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 TCHPQ9BT92 498 aa22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 OGTO15294 1046 aa22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 SEPT4O43236 478 aa22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 PGK1P00558 417 aa22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 KIF22Q14807 665 aa22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 NLRP7Q8WX94 980 aa22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 96.1
VRK2-201ENST00000340157 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.96■■□□□ 1.27
VRK2-201ENST00000340157 YY1P25490 414 aa22.95■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 HOXC8P31273 242 aa22.95■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 MAP2K2P36507 400 aa22.95■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 PRKCIP41743 596 aa22.95■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.95■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.95■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 KAT5Q92993 513 aa22.95■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 WDR24Q96S15 920 aa22.95■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 CDT1Q9H211 546 aa22.95■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 GPR32O75388 356 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 SOX5P35711 763 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 KRT83P78385 493 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 PTK2Q05397 1052 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 KIZQ2M2Z5 673 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 ZACNQ401N2 412 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 CEP120Q8N960 986 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 FNBP1Q96RU3 617 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 DEF6Q9H4E7 631 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 SRRDQ9UH36 339 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 TREHO43280 583 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 AKR1B10O60218 316 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 ZEB2O60315 1214 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 GFPT2O94808 682 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 RFX1P22670 979 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 NKX3-2P78367 333 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 ZNF410Q86VK4 478 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 CGRRF1Q99675 332 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 RAB20Q9NX57 234 aa22.94■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 GPR25O00155 361 aa22.93■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 CYP2C9P11712 490 aa22.93■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 TNNI1P19237 187 aa22.93■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 STAT1P42224 750 aa22.93■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.93■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 GNASQ5JWF2 1037 aa22.93■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.93■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.93■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 CPB2Q96IY4 423 aa22.93■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.93■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.93■■□□□ 1.26
VRK2-201ENST00000340157 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms